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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 其他 » 请问Equilibrium isotope effects如何计算？
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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921

[求助] 请问Equilibrium isotope effects如何计算？ 已有1人参与

向各位高手求助，文章审稿人让我计算Equilibrium isotope effects，但在高斯手册查到只是笼统的readisotopes，在小木虫里搜到了kinetic isotope effect (KIE)的帖子，但是两者的计算公式不一样。也有用readisotopes计算同位素效应的帖子，可是每个回复者的答案有差别，也不确定是不是适应于Equilibrium isotope effects。
请问Equilibrium isotope effects该如何计算？用高斯可以计算吗？谢谢
请问Equilibrium isotope effects如何计算？
kinetic isotope effect (KIE)


请问Equilibrium isotope effects如何计算？-1
Equilibrium isotope effects
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为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
1楼 2014-02-17 10:59:15
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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921
引用回帖:
8楼: Originally posted by CKX at 2014-04-06 06:36:38
好的

什么意思
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为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
9楼2014-04-06 09:01:18
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agent99

禁虫 (正式写手)

物化程序猿

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+4 2014-02-19 09:39:07
其实KIE和EIE可以用同样的方法计算，区别就是计算反应物-过渡态还是反应物-产物过程的isotope effect。具体公的讲述Cramer的书里应该有，基本思想就是转动和振动（主要是后者）配分函数的mass-dependency导致了反应速率常数或平衡常数会被同位素取代所改变（前者为KIE，后者则是EIE了）。你的两张图上列出了两种不同的方法，第一个公式大概是直接把配分函数的表达式代入Eyring方程得到的，第二个像是Bigeleisen-Mayer方程（原始文献是Bigeleisen的一篇JCP，大概是1948-49年，记不清了...）。具体到计算上，可以有如下两种方法：
1.对反应物和产物结构作同位素取代（readisotope）后作振动分析，得到各个配分函数的值，然后和未同位素取代的反应物和产物的配分函数一起代入公式1（把过渡态#换成产物就行）。或者，更直接地，看公式1左边，可以直接把同位素取代和未取代的两个反应的K直接算出来（K = exp(-dG/RT))然后比一下，是等价的。
2.做同样的计算，不过不取用配分函数而取频率值，代入2.（2里的u就是频率，注意高斯输出的是波数，需要转换一下）。
两种方法都可以自己写个简单的脚本实现的。
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理论与计算化学，化学物理，生物物理
2楼2014-02-19 08:37:46
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游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921
引用回帖:
2楼: Originally posted by agent99 at 2014-02-19 08:37:46
其实KIE和EIE可以用同样的方法计算，区别就是计算反应物-过渡态还是反应物-产物过程的isotope effect。具体公的讲述Cramer的书里应该有，基本思想就是转动和振动（主要是后者）配分函数的mass-dependency导致了反应 ...

非常感谢您的解答，这天阅读了审稿人给我的一篇文献，文章说明用ISOEFF98计算，但我进不去官网下载不了，请问我该怎么办？用您说的写脚本去计算？
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为了自己的目标而奋斗，一切皆有可能
3楼2014-02-19 23:37:27
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agent99

禁虫 (正式写手)

物化程序猿

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
游子8921: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 非常感谢 2014-02-20 09:13:47
发email给isoeff的作者piotr paneth试试？
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理论与计算化学，化学物理，生物物理
4楼2014-02-20 04:19:21
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