24小时热门版块排行榜    

查看: 745  |  回复: 2

chenqiao13

木虫 (正式写手)

悬铃木

[求助] 求助大神以下这种情况该怎么办? 已有1人参与

做了一个单晶,但是审稿人一直有意见,请大家帮忙分析下是什么原因,能给出解决方案者必重谢!
下面是两次的审稿意见,拜托了。

第一次的意见
- NOTE:  we checked the CIF file using the International Union of Crystallography facility found at:  http://checkcif.iucr.org/ and found serious alerts (level A) which may indicate errors – see attached checkcif report (PDF file) and comments from our data analyst (below).  Please correct the errors, or add a comment to the CIF file explaining the significance of the alerts.
COMMENTS:
The structure appears to contain two water molecules of crystallisation, however the hydrogen atoms of these water molecules have been attached in a chemically unreasonable way (see the attached picture).  The hydrogen atoms, need to be re-located (it is possible that theye are disordered as the oxygen atoms do not seem to make any sensible H-bond contacts with the main residue.  Otherwise the structure is OK.  

我联系做单晶的老师,那个老师说是因为单晶中有两个水分子造成的,他把水分子去掉后,我再投,审稿人依然有意见,意见如下:
Notes from CIF analyst:
The authors have opted to employ the solvent masking procedure in OLEX (similar to SQUEEZE) which is used to remove the contributions from disordered solvent.  The water oxygens did not appear to be disordered, simply the H atoms were incorrectly placed, but this is their choice. However, if OLEX is applied, then the cif should not only contain details of this procedure, but the unit cell contents should include those atoms which were removed. Failure to do this results in an incorrect F000 and crystal density.  Finally, a note should be added to the refinement_special_details detailing this procedure and why it was applied.


我现在都不知道该怎么办了,做单晶的老师也没有什么办法。请各位高手,大侠救命!感激不尽!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

飞鸟
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chenqiao13: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-02-16 19:07:02
第一,两个结晶水的问题是加H位置不合理,应该手动调整其位置,使其处理于化学上合理的位置。
第二,扣除了两个水分子,应该在分子式的表达行里加上两个 O和4个H,以便于计算的电子总数 F000一致。
2楼2014-02-16 13:21:04
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenqiao13

木虫 (正式写手)

悬铃木

引用回帖:
2楼: Originally posted by yytsnake at 2014-02-16 13:21:04
第一,两个结晶水的问题是加H位置不合理,应该手动调整其位置,使其处理于化学上合理的位置。
第二,扣除了两个水分子,应该在分子式的表达行里加上两个 O和4个H,以便于计算的电子总数 F000一致。

感谢您!第一,做单晶的单晶老师说H的位置找不到,可能是单晶养的不够好。那两分子水本不是我的化合物的,是在养单晶的过程中形成的。H的位置找不到,这单晶能用吗?
第二,您的意思是可以去掉两个水分子,但是要在分子式的表达行里加上两个 O和4个H?晶体中把水去掉,单纯在分子式中加上那两分子水?
再次感谢,请大师指条明路!
飞鸟
3楼2014-02-16 19:07:06
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chenqiao13 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 药学383 求调剂 +3 药学chy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 20:51 by 元子^0^
[考研] 0854控制工程 359求调剂 可跨专业 +3 626776879 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:42 by 626776879
[基金申请] 今年的国基金是打分制吗? 50+3 zhanghaozhu 2026-03-14 3/150 2026-03-16 17:07 by 北京莱茵润色
[考研] 一志愿苏州大学材料工程(085601)专硕有科研经历三项国奖两个实用型专利一项省级立项 +3 大火山小火山 2026-03-16 5/250 2026-03-16 16:54 by barlinike
[考研] 一志愿211 0703方向310分求调剂 +3 努力奋斗112 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:44 by houyaoxu
[考研] 材料与化工求调剂 +3 为学666 2026-03-16 3/150 2026-03-16 15:09 by 加号+
[考研] 326求调剂 +4 上岸的小葡 2026-03-15 5/250 2026-03-16 08:39 by Linda Hu
[考研] 【0703化学调剂】-一志愿华中师范大学-六级475 +5 Becho359 2026-03-11 5/250 2026-03-14 11:35 by 哦哦123
[考研] 考研材料与化工,求调剂 +8 戏精丹丹丹 2026-03-09 8/400 2026-03-14 01:14 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中农业大学071010,总分三百二,求调剂 +3 困困困困坤坤 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:35 by JourneyLucky
[考研] 求材料调剂 085600英一数二总分302 前三科235 精通机器学习 一志愿哈工大 +4 林yaxin 2026-03-12 4/200 2026-03-13 22:04 by 星空星月
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[考研] 281求调剂 +9 Koxui 2026-03-12 11/550 2026-03-13 20:50 by Koxui
[考研] 301求调剂 +6 Liyouyumairs 2026-03-11 6/300 2026-03-13 20:11 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 程雨杭 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:06 by JourneyLucky
[考研] 土木第一志愿276求调剂,科研和技能十分丰富,求新兴方向的导师收留 +3 土木小天才 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:01 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:30 by 求调剂zz
[考研] 哈工大材料324求调剂 +6 闫旭东 2026-03-10 8/400 2026-03-10 22:49 by 星空星月
[考研] 化工0817调剂 +8 灿若星晨 2026-03-10 8/400 2026-03-10 22:44 by 星空星月
[考研] 298求调剂 +3 Vv呀! 2026-03-10 3/150 2026-03-10 22:40 by 剑诗杜康
信息提示
请填处理意见