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一休陈

金虫 (正式写手)

[求助] 关于二倍体酿酒酵母基因敲除的疑问 已有2人参与

各位虫友大家新年好。
    我最近开始做二倍体酿酒酵母基因的敲除工作,现在遇到两个疑问:其一,构建一个(上游同源臂+G418抗性基因+下游同源臂)的敲除盒,一次转化,有没有可能将两个等位基因同时敲除?这样的话,我用菌落PCR验证,P不出来目的基因条带的且带有G418抗性的菌落岂不就是敲除的阳性菌落? 其二,如果第一点不成立,即是一个敲除盒经过一次转化只能敲除一个等位基因的话,第二个基因我怎么敲除呢?还望有二倍体酿酒酵母敲除经验的虫友们多多指教!再次祝福大家新年快乐,马年龙马精神,百尺竿头,更进一步!谢谢。
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beer胖

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
一休陈: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢。还希望以后能够得到您的指教。非常感谢。祝福虫友马年快乐。 2014-02-17 11:02:39
如果二倍体酵母HO基因没有活性的话,就直接先分单倍体,再做基因敲除,而且还可以不用抗性基因,直接用尿嘧啶缺陷型就行;然后再用HO基因恢复为二倍体或两种配型的工程菌交配获得二倍体,单倍体很好分离的,直接生孢后蜗牛酶破壁,涂板筛选就行了。
直接以二倍体进行基因敲除的话,也有可能会产生两个等位基因的敲除,只是概率极低,难度很大。很幸运的是我再敲除二倍体HO基因的时候获得了两个等位基因HO基因均被敲除的突变体。
11楼2014-02-17 10:01:22
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l68266152

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
一休陈: 金币+5, 有帮助 2014-02-13 15:20:43
基本不会出现同时双敲的情况。只要有一个拷贝就可以获得抗性的情况下,生物不会浪费多余的精力去弄第二个。

后续试验思路:
1、分单倍体;
2、用另外的抗生素标签敲除另一个基因。
相信自己
2楼2014-02-12 16:31:17
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yuanbo934

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
一休陈: 金币+5, 有帮助 2014-02-13 15:44:12
补充一下楼上,首先要把阳性克隆诱导产孢然后用蜗牛酶和纤维素酶处理掉壁,在导致显微镜下分离単孢,在抗生素的培养基上和PCR验证哪两个孢子或四个孢子全部含有抗性基因,将阳性孢子传代,在HO基因的作用下,变成二倍体酵母,即纯合体酵母。
3楼2014-02-13 15:21:40
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一休陈

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by l68266152 at 2014-02-12 16:31:17
基本不会出现同时双敲的情况。只要有一个拷贝就可以获得抗性的情况下,生物不会浪费多余的精力去弄第二个。

后续试验思路:
1、分单倍体;
2、用另外的抗生素标签敲除另一个基因。

那请问我首先通过构建一个(上游同源臂+G418抗性基因+下游同源臂)的敲除盒,第一次转化敲除一个等位基因;然后利用Cre酶切掉G418抗性基因;再在这个目的基因内部区域设计并构建敲除盒,第二进行不完全敲除的话,这样的可行性大吗?
4楼2014-02-13 15:23:46
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