| 查看: 1205 | 回复: 6 | |||
quantumzx木虫 (初入文坛)
|
[求助]
Gromacs 如何选出基团附近特定范围内的分子 已有1人参与
|
|
我做了一个DNA分子在水溶液中的MD simulation, 并从 .trr 文件生成了每隔几ps 的构型输出到了 .pdb文件 现在我需要把一个碱基和周围特定半径内的水分子选出来做QM计算， 请问如何从 .pdb file 中找到这些水分子？ 谢谢! |
回复此楼» 猜你喜欢
人气不行了
已经有6人回复
-
今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果
已经有18人回复
-
感觉是下周放榜了
已经有12人回复
-
看来今天不会放榜了？
已经有5人回复
-
我面上完蛋了
已经有8人回复
-
只有每年这种时候来逛逛小木虫
已经有25人回复
-
什么时候开奖？
已经有7人回复
-
时间戳又变了
已经有18人回复
-
时间戳又变了8-15
已经有27人回复
-
今天基金会出结果吗？20260819
已经有16人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-01-28 20:48:47
quantumzx: 金币+50, ★★★很有帮助 2014-01-29 01:12:56
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-01-28 20:48:47
quantumzx: 金币+50, ★★★很有帮助 2014-01-29 01:12:56
|
本帖内容被屏蔽 |
2楼2014-01-28 11:13:03
quantumzx
木虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3929
- 帖子: 9
- 在线: 32.1小时
- 虫号: 1130827
- 注册: 2010-10-24
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2014-01-29 01:13:01
quantumzx
木虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3929
- 帖子: 9
- 在线: 32.1小时
- 虫号: 1130827
- 注册: 2010-10-24
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
4楼2014-01-29 06:18:34
★ ★
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流 2014-01-29 09:37:48
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流 2014-01-29 09:37:48
|
本帖内容被屏蔽 |
5楼2014-01-29 07:55:57
quantumzx
木虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3929
- 帖子: 9
- 在线: 32.1小时
- 虫号: 1130827
- 注册: 2010-10-24
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
6楼2014-01-29 08:50:06
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-01-29 09:38:13
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2014-01-29 09:38:13
|
本帖内容被屏蔽 |
7楼2014-01-29 08:55:12
40