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quantumzx木虫 (初入文坛)
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Gromacs 如何选出基团附近特定范围内的分子 已有1人参与
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我做了一个DNA分子在水溶液中的MD simulation, 并从 .trr 文件生成了每隔几ps 的构型输出到了 .pdb文件 现在我需要把一个碱基和周围特定半径内的水分子选出来做QM计算， 请问如何从 .pdb file 中找到这些水分子？ 谢谢! |
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quantumzx
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5楼2014-01-29 07:55:57
quantumzx
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