24小时热门版块排行榜    

查看: 671  |  回复: 6
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

weile_0

银虫 (小有名气)

[交流] 大片段DNA(6.4K)与载体连接所需的载体,反转录酶,PCR聚合酶的选择!!!

各位大侠:小弟最近做个长片段的cDNA与T载体的连接,片段大小6.4K,载体选用的是pUC19和pGEMT-easy ,反转录酶用的是RevertAid Tirst Strand cDNA Synthesis Kit (#K1621),CDNA第二链的扩增用的是LA Taq 。我是用纯病毒的RNA做模板,操作步骤严格按照说明做的,也曾经有一次获得过电泳图清晰显示的是全长6.4KB左右的片段,与载体连接,结果筛选到的几个克隆,插入的片段仅有2KB左右,奈何?可最近几次再用此反转录试剂盒却不能得到所需片段。在此,小弟想问问大家,你们是否遇到同样的问题,是如何解决的?所用的试剂(载体和酶的选择)和方法是什么,可以告诉后来者,共同进步吧。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

克隆大虾

铁杆木虫 (著名写手)

6.4kb应该没问题,放手干,我往pGEM-T连过6kb的
6楼2008-01-16 00:44:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

pxmyz

银虫 (小有名气)

[[结果筛选到的几个克隆,插入的片段仅有2KB左右,奈何?]],你可能是用PCR的方法先初步鉴定筛选的吧。你鉴定的那个插入有2KB左右的克隆或许是空载体。因为空载体上有跟你目的片段同源性很高的区域,这很有可能与你引物结合,扩增出2KB左右的条带。你可以做PCR是挑一个蓝斑做对照。至于用此反转录试剂盒却不能得到所需片段,可能与提取的RNA等都有关系,需要你实验中自己摸索。
Ican,Ido.
2楼2008-01-15 16:58:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

weile_0

银虫 (小有名气)

你好,pxmyz,谢谢你的回复。我得到的2KB片段是我的所克隆病毒基因的3‘端,只有很少的几十个BP的载体片段,现在我准备分段连接和长片段克隆同时进行。
3楼2008-01-15 17:40:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ypan

木虫 (著名写手)

片段太长,与pUC19和pGEMT-easy 连接很可能连接不上去,即使偶尔连接上去,在宿主细胞也很难复制,目的片段会丢失!
建议用个比较大的克隆载体,如噬菌体载体!
祝你好运!
4楼2008-01-15 18:39:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见