应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » shell脚本修改nodes
51/1返回列表
查看: 1697  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

飞翔……

金虫 (正式写手)

[求助] shell脚本修改nodes 已有2人参与

用侯博士的脚本，发现计算时是 running on    1 nodes，比较慢，如果服务器有6个nodes可用的话，如何修改脚本以最大的发挥其功能。
shell脚本修改nodes
1.JPG
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-01-18 22:50:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飞翔……

金虫 (正式写手)
我是学的其他编程语言，没讲清楚，不好意思，谢谢你的回复！
赞一下 回复此楼
7楼2014-01-20 12:21:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
飞翔……: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-01-19 21:18:08
time vasp那里需要改成服务器需要的并行命令。这命令依赖于服务器，需要咨询管理员。同时可以还需要设置别的东西。
赞一下 回复此楼
2楼2014-01-19 00:13:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
飞翔……: 金币+15, ★★★★★最佳答案 2014-01-19 21:18:14
這叫單機計算~只用了一個 core
若是有多個 cores 可用~則可一次使用多個
比方
一次做六個
#!/bin/bash
for i in 150 200 250 300 350 400
do
mkdir $i
cp POSCAR POTCAR KPOINTS $i
cd $i
cat > INCAR <<!
SYSTEM=Si-Diamond
ENCUT=$i
ISTART=0;ICHARG=2
ISMEAR=-5
PREC=Accurate
!
echo "ENCUT=$i eV"; time vasp &
E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f\n",$5}`
echo $i $E >> ../comment
cd ..
done
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

飞翔……
3楼2014-01-19 03:26:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飞翔……

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jpchou at 2014-01-19 03:26:25
這叫單機計算~只用了一個 core
若是有多個 cores 可用~則可一次使用多個
比方
一次做六個
#!/bin/bash
for i in 150 200 250 300 350 400
do
mkdir $i
cp POSCAR POTCAR KPOINTS $i
cd $i
cat > INCAR ...

你好！  你能帮我把每一行都标个注释吗？说明这行是用来干什么的。学过其一些编程，但不懂Shell。谢谢啦
赞一下 回复此楼
4楼2014-01-19 21:25:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭