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飞翔……金虫 (正式写手)
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shell脚本修改nodes 已有2人参与
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用侯博士的脚本，发现计算时是 running on 1 nodes，比较慢，如果服务器有6个nodes可用的话，如何修改脚本以最大的发挥其功能。 1.JPG |
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飞翔……
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6楼2014-01-20 12:20:11
2楼2014-01-19 00:13:33
【答案】应助回帖
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飞翔……: 金币+15, ★★★★★最佳答案 2014-01-19 21:18:14
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飞翔……: 金币+15, ★★★★★最佳答案 2014-01-19 21:18:14
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這叫單機計算~只用了一個 core 若是有多個 cores 可用~則可一次使用多個 比方 一次做六個 #!/bin/bash for i in 150 200 250 300 350 400 do mkdir $i cp POSCAR POTCAR KPOINTS $i cd $i cat > INCAR <<! SYSTEM=Si-Diamond ENCUT=$i ISTART=0;ICHARG=2 ISMEAR=-5 PREC=Accurate ! echo "ENCUT=$i eV"; time vasp & E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f\n",$5}` echo $i $E >> ../comment cd .. done |
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飞翔……3楼2014-01-19 03:26:25
飞翔……
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