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meatball1982

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于微扰对系统的影响

大家好。
  我有一个生物体的变化系统。其中的一个微扰使得系统向着两个完全不同的方向发展(比如说是A,B)。而这两个方向A,B还是可以相互转化的。
  我觉得这个可以用混沌理论(只是大体了解)进行研究。但具体的,要用什么数学工具,一点思路也没有。
  我的问题是
  1.要用混沌中的什么变量或是概念来研究我的问题。
  2.如果不用混沌理论,我应该用哪些数学工具来进行研究。
  请大家给提供点思路。或是有这类研究方向的先例,最好。
  
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唉。还是学吧。
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meatball1982

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by laosam280 at 2014-01-18 11:25:47
楼主,我说的就是小木虫呢。
您把您的问题具体的贴出来,包括一些必要的建模思路和数据,大家可以更方便的帮你看看。

我有一个蛋白质,叫pro,它是由42个氨基酸组成的,分别是res1,res2.res3,...,res42.
因为pro在不同的情况下,会变成proA,或是proB.而怎么改变的,我暂时(应该是很长时间之内)不大可能知道。但我知道,如果突变其中的某一个res或是几个res,经过很长的时间(我通过分子动力学模拟基本是作不出来的,因为计算资源不够,时间又太少。),proA会变成proB(这是一个文献中说的,是另一种pro,但这两种pro类似。).

于是,我的思路是,
01.首先要知道哪一个氨基酸res对这个蛋白质pro的影响比较大。只针对这个res来深入研究。
02.在找哪个氨基酸res对蛋白质pro影响较大时,我不知道应该用什么数学方法。
是于,我将某个氨基酸res固定,就是不让它突变,在正常的条件的基础上,将整个蛋白质pro作一定的改变,比如增加温度,看蛋白质pro整体的变化趋势(比如能量变大变小,结构改变多少),如果与未固定氨基酸时,增加温度的蛋白质的变化趋势一致,则说明这个氨基酸对蛋白质的影响小。
就是在比较这两种变化趋势时,我遇到了问题。因为我得到的是两个情况下蛋白质变化的轨迹,所以,我不知道我应该用什么数学工具来进行比较。
唉。还是学吧。
7楼2014-02-04 08:43:27
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laosam280

禁虫 (正式写手)

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感谢参与,应助指数 +1
meatball1982: 金币+50, ★★★很有帮助, 提供思路。可能需要进一步咨询。 2014-01-18 10:32:43
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2楼2014-01-17 23:39:46
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meatball1982

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by laosam280 at 2014-01-17 23:39:46
请列出你的系统,群里做动力系统稳定性的人应该能给你回答。

按照我做生物系统的经验,一般的生物种群系统对参数有严重的依赖性(比如某一种群的出生率和死亡率)等。可以利用平衡点的稳定性分析方法求出大致或者 ...

我有一个蛋白质ori,可以通过突变其中的某个氨基酸res,使ori变成A.或是通过突变另一个res变成B.而AB之间又可以通过折叠或是打开折叠相互转化。
老板给我讲的内容,我能理解的就是这个意思。因为可以突变的res有很多,所以我想通过将突变看成是对系统的一个扰动。进而观察不同的res的哪些变量(就是我帖子当中想学习的数学的变量)来分析对不同res进行突变对整个系统的影响。
唉。还是学吧。
3楼2014-01-18 10:28:13
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meatball1982

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by laosam280 at 2014-01-17 23:39:46
请列出你的系统,群里做动力系统稳定性的人应该能给你回答。

按照我做生物系统的经验,一般的生物种群系统对参数有严重的依赖性(比如某一种群的出生率和死亡率)等。可以利用平衡点的稳定性分析方法求出大致或者 ...

您说的群,请问如何加入。谢谢。
唉。还是学吧。
4楼2014-01-18 10:33:09
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