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【推荐】免费同源模建软件——模拟蛋白侧链结构
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对于同源模建，Modeller是最经典的同源模建软件，对学术用户免费： http://salilab.org/modeller/ swiss-model服务器也可以进行在线模建： http://swissmodel.expasy.org//SWISS-MODEL.html 这里，对于蛋白质的侧链模建，推荐一款新的软件： SCWRL SCWRL目前版本为3.0，由Dunbrack教授实验室开发，对学术用户免费，可以从下面申请，在半天内就可以收到下载链接的邮件。一般下载链接有效期为5天。 http://dunbrack.fccc.edu/SCWRL3.php 当然，在其实验室还有很多其他免费工具： MolIDE：同源模建的图形操作界面。需要通过电子邮件申请下载链接 http://dunbrack.fccc.edu/molide/molide.php XML2PDB ： 由pdb文件中提取结构信息，由pdbaa，pdbnt文件中提取序列信息等。 不需要注册，直接下载。链接： Linux：http://dunbrack.fccc.edu/xml2pdb_dl/xml2pdb_lin.tar.gz Windows：http://dunbrack.fccc.edu/xml2pdb_dl/xml2pdb_win.zip ProtBuD是PDB数据库的衍生库，需要注册获取下载链接： http://dunbrack.fccc.edu/ProtBuD/ProtBuD.php 如果觉得这个对于研究能有一些启发作用，希望大家能顶一下！ |
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