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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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wjmed

木虫 (正式写手)


[资源] 【推荐】免费同源模建软件——模拟蛋白侧链结构

对于同源模建,Modeller是最经典的同源模建软件,对学术用户免费:
http://salilab.org/modeller/
swiss-model服务器也可以进行在线模建:
http://swissmodel.expasy.org//SWISS-MODEL.html

这里,对于蛋白质的侧链模建,推荐一款新的软件: SCWRL
SCWRL目前版本为3.0,由Dunbrack教授实验室开发,对学术用户免费,可以从下面申请,在半天内就可以收到下载链接的邮件。一般下载链接有效期为5天。
http://dunbrack.fccc.edu/SCWRL3.php

当然,在其实验室还有很多其他免费工具:
MolIDE:同源模建的图形操作界面。需要通过电子邮件申请下载链接
http://dunbrack.fccc.edu/molide/molide.php

XML2PDB : 由pdb文件中提取结构信息,由pdbaa,pdbnt文件中提取序列信息等。
不需要注册,直接下载。链接:
Linux:http://dunbrack.fccc.edu/xml2pdb_dl/xml2pdb_lin.tar.gz
Windows:http://dunbrack.fccc.edu/xml2pdb_dl/xml2pdb_win.zip

ProtBuD是PDB数据库的衍生库,需要注册获取下载链接:
http://dunbrack.fccc.edu/ProtBuD/ProtBuD.php

如果觉得这个对于研究能有一些启发作用,希望大家能顶一下!
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huiyuli

金虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

谢谢,资源共享!
2楼2008-01-09 23:53:25
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谢谢,希望我能搞定
4楼2008-09-02 11:00:16
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简单回复
子陵2633楼
2008-03-22 07:12   回复  
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