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请问谁做过dcaps啊 已有1人参与
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| 各位同仁，有谁做过dcaps吗？请问引物怎么设计，还有限制性内切酶怎么确定？用过dCAPS Finder 2.0这个软件吗？结果怎么看啊 |
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7楼2014-01-07 17:43:09
lvbobo823
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摩羯的心(kx444555代发): 金币+3, 鼓励交流 2014-01-07 08:48:35
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我们都是在线分析的网址http://helix.wustl.edu/dcaps/dcaps.html 你试试看，内切酶选择主要是价格便宜并且在PCR buffer里直接能工作的最好。 |
2楼2014-01-06 15:42:28
3楼2014-01-07 08:53:50
lvbobo823
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| 你提供的这网站上中前三个引物都是在wild type上能够被酶切开的。拿GsuI来说引物上突变TATG-TcTG与野生型序列中GAG复制时形成酶切位点，而突变序列中形不成。选择哪一酶切位点也与你实验室常用的酶相关，我们实验室用的NEB的酶，查了一下GsuI在NEB目录里没有，Hpy178III在NEB目录名为Hpy188III在普通的PCR buffer工作效率<+表明需要纯化PCR产物在该酶buffer里做酶切。而TaqI在普通PCR buffer中效率+++表明适用，若你的标记不大建议用TaqI价格合理，效率高。 |
4楼2014-01-07 09:25:10
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