24小时热门版块排行榜    

查看: 4057  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

摩羯的心

铁虫 (小有名气)

[求助] 请问谁做过dcaps啊 已有1人参与

各位同仁,有谁做过dcaps吗?请问引物怎么设计,还有限制性内切酶怎么确定?用过dCAPS Finder 2.0这个软件吗?结果怎么看啊
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

摩羯的心

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-01-07 09:25:10
你提供的这网站上中前三个引物都是在wild type上能够被酶切开的。拿GsuI来说引物上突变TATG-TcTG与野生型序列中GAG复制时形成酶切位点,而突变序列中形不成。选择哪一酶切位点也与你实验室常用的酶相关,我们实验室 ...

非常感谢,能再问一下你们实验室,引物中引入错配碱基,做PCR的时候用的聚合酶是什么啊?用该是保真性不太好,不具有3’-5‘外切酶活性的吧?能推荐一下吗   谢啦
5楼2014-01-07 11:29:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
摩羯的心(kx444555代发): 金币+3, 鼓励交流 2014-01-07 08:48:35
我们都是在线分析的网址http://helix.wustl.edu/dcaps/dcaps.html
你试试看,内切酶选择主要是价格便宜并且在PCR buffer里直接能工作的最好。
hehe
2楼2014-01-06 15:42:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

摩羯的心

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lvbobo823 at 2014-01-06 15:42:28
我们都是在线分析的网址http://helix.wustl.edu/dcaps/dcaps.html
你试试看,内切酶选择主要是价格便宜并且在PCR buffer里直接能工作的最好。

我用你说的这个在线软件分析过,但我不明白结果怎么看,能帮我分析一下吗?我附上结果的一部分  麻烦咯
请问谁做过dcaps啊
无标题.png

3楼2014-01-07 08:53:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
gyesang: 金币+3, 鼓励交流! 2014-01-07 10:21:37
摩羯的心: 金币+7, ★★★很有帮助 2014-01-07 11:28:32
你提供的这网站上中前三个引物都是在wild type上能够被酶切开的。拿GsuI来说引物上突变TATG-TcTG与野生型序列中GAG复制时形成酶切位点,而突变序列中形不成。选择哪一酶切位点也与你实验室常用的酶相关,我们实验室用的NEB的酶,查了一下GsuI在NEB目录里没有,Hpy178III在NEB目录名为Hpy188III在普通的PCR buffer工作效率<+表明需要纯化PCR产物在该酶buffer里做酶切。而TaqI在普通PCR buffer中效率+++表明适用,若你的标记不大建议用TaqI价格合理,效率高。
hehe
4楼2014-01-07 09:25:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 4FFAWE8HcgUD 2026-08-29 4/200 2026-08-30 20:40 by hZiFeudZyoGR
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4FFAWE8HcgUD 2026-08-29 5/250 2026-08-30 20:29 by hZiFeudZyoGR
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 zICmwzsBXjbN 2026-08-29 5/250 2026-08-30 20:08 by hZiFeudZyoGR
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 4/200 2026-08-30 19:57 by hZiFeudZyoGR
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 7/350 2026-08-30 19:45 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 4/200 2026-08-30 19:34 by hZiFeudZyoGR
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 4/200 2026-08-30 19:13 by hZiFeudZyoGR
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-30 19:07 by xiangy672
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 5/250 2026-08-30 18:51 by hZiFeudZyoGR
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 5/250 2026-08-30 18:40 by hZiFeudZyoGR
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 18:18 by hZiFeudZyoGR
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +7 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 11/550 2026-08-30 17:34 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-30 17:14 by hZiFeudZyoGR
[基金申请] 面上意见出来了 +9 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 18/900 2026-08-30 16:47 by 黄鸟于飞Chao
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 5/250 2026-08-30 14:03 by GkCVyODlx4mR
[基金申请] 29号明天会评吗 +3 笨笨唐 2026-08-28 3/150 2026-08-30 09:29 by cww8181
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
信息提示
请填处理意见