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jiaojiaotony

金虫 (初入文坛)

[求助] pair_style lj/cut/coul/cut command的使用 已有1人参与

pair_style lj/cut/coul/cut command 是带电荷的L-J势,manual里面解释Qi and Qj are the charges on the 2 atoms,
我现在的疑惑是Qi and Qj 的电性、位置、电荷怎么设置以及如何等效成电势?目前建立的模型是中间有一定的距离上下两层物质,我现在就只在上层加了一些电性相同的电荷,下层不带电荷。
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笑笑愁

金虫 (小有名气)

未知

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 感谢指导。 2014-01-02 10:42:34
jiaojiaotony: 金币+5, 有帮助 2014-01-07 19:11:39
电荷是在模型里面加在每个原子上,电性用正负,电荷大小要根据你用的单位units命令来定啊(看这部分手册);至于电势是通过电荷计算的啊,你如果要计算两层物质的相互作用,那么下层应该也有电荷,如果计算流体与模型之间的作用,那么流体应该有电荷;否则加电荷无意义
有志者,事竟成。
2楼2014-01-02 09:15:57
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jiaojiaotony

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 笑笑愁 at 2014-01-02 09:15:57
电荷是在模型里面加在每个原子上,电性用正负,电荷大小要根据你用的单位units命令来定啊(看这部分手册);至于电势是通过电荷计算的啊,你如果要计算两层物质的相互作用,那么下层应该也有电荷,如果计算流体与模 ...

你说的加电荷我看了manual ,我用的是set命令:set     group   g2  charge -2,在石墨烯的每个原子上加电荷,in文件中units为metal。我主要是想在这两层之间加一个静电力,不知道怎样可以实现?
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3楼2014-01-02 14:55:49
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笑笑愁

金虫 (小有名气)

未知


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-01-03 09:14:07
引用回帖:
3楼: Originally posted by jiaojiaotony at 2014-01-02 14:55:49
你说的加电荷我看了manual ,我用的是set命令:set     group   g2  charge -2,在石墨烯的每个原子上加电荷,in文件中units为metal。我主要是想在这两层之间加一个静电力,不知道怎样可以实现?...

加了电荷,pair_style lj/cut/coul/cut,另外再用pair_coeff 设置LJ和库仑力的作用参数,这样就可以了。另外,加电荷也可以在data文件里实现;set命令我没用过,希望你加的不是group电荷总和是-2. 祝好运
有志者,事竟成。
4楼2014-01-02 15:08:49
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jiaojiaotony

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 笑笑愁 at 2014-01-02 15:08:49
加了电荷,pair_style lj/cut/coul/cut,另外再用pair_coeff 设置LJ和库仑力的作用参数,这样就可以了。另外,加电荷也可以在data文件里实现;set命令我没用过,希望你加的不是group电荷总和是-2. 祝好运...

由于我所用的上层石墨烯的数据在data文件里,所以上层石墨烯的电荷是在data文件里面加的,下层SiO2是在in文件里用set命令加的电荷,且上下两层的电荷相等,电性相反,不知道这样形成电势对不对?
做最好的自己
5楼2014-01-02 16:58:21
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笑笑愁

金虫 (小有名气)

未知

引用回帖:
5楼: Originally posted by jiaojiaotony at 2014-01-02 16:58:21
由于我所用的上层石墨烯的数据在data文件里,所以上层石墨烯的电荷是在data文件里面加的,下层SiO2是在in文件里用set命令加的电荷,且上下两层的电荷相等,电性相反,不知道这样形成电势对不对?...

看你描述应该没问题。我不知道你的模型是在做什么,但是凭感觉应该是SiO2中Si和O有电荷但总和为零,石墨烯碳原子不带电
有志者,事竟成。
6楼2014-01-02 18:28:24
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