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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 急！lammps安装修改makefile.g++文件后运行出错。
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匿名

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1楼 2013-12-30 20:21:58
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z654023015

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zztaisen: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-12-31 11:23:12
月只蓝: 金币+1, 感谢指导。 2013-12-31 16:38:06
现在src下面 make no-lib 再make g++。gpu等一些包的安装，需要另外安装
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2楼2013-12-30 21:32:52
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普通回帖

匿名

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3楼2013-12-31 11:34:13
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 感谢指导。 2013-12-31 16:38:14
你得装一个voro++到你的机器里，参见http://lammps.sandia.gov/doc/compute_voronoi_atom.html
和http://math.lbl.gov/voro++/about.html

如果必要的话，可能还要修改Makefile.lammps里voro++的路径，参见这个人在github上包含有voronoi的lammps说明https://github.com/CFDEMproject/LAMMPS/tree/master/src/VORONOI

如果你不需要voronoi，直接make no-voronoi把这个package删掉，这样也省事。
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4楼2013-12-31 13:03:39
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匿名

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5楼2013-12-31 16:36:25
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
zztaisen: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 谢谢帮助 2014-01-01 14:15:15
引用回帖:
5楼: Originally posted by zztaisen at 2013-12-30 20:36:25
你好！我把voronoi包删掉后再运行这次运行的时间更长了，感觉离编译成功更近了，不过又出现如下错误：

make: ***  错误 1
make:正在离开目录 `/user/local/lammps/src/Obj_g++'
make: ***  错误 2
root@ubun ...

你确定要用OpenMP(OMP)来并行化你的程序吗？如果不需要，把USER－OMP包删掉: make no-USER-OMP

如果你确实需要OpenMP，参照这个回答修改代码再重新编译。
http://lammps.sandia.gov/threads/msg41688.html

貌似你一开始用了make yes-all把所有的包都装上去了，其实不需要，选几个自己需要的包装就行了。
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6楼2014-01-01 02:22:47
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匿名

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7楼2014-01-01 14:15:23
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AB石头

铜虫 (小有名气)
同学，你后来解决了么？我也出现跟你一样的问题。
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8楼2014-09-06 09:32:10
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jfyh2008

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zztaisen at 2013-12-31 11:34:13
朋友，谢谢你的回答。不过我后来运行发现提示lib目录下含有atc,awpmd, colvars,cuda,gpu, linalg, meam, poems和reax文件夹下没有makefile.lammps文件，我想应该是我没有编译编译库文件的原因所以我就一一的进去库 ...

请问你是怎么样"生成静态库文件lib*.a和配置文件Makefile.lammps",我也在作这方面的内容,不过是想要建立atc的librar,请详细说一说,谢谢
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9楼2014-12-16 10:51:18
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jfyh2008

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by lsloneil at 2014-01-01 02:22:47
你确定要用OpenMP(OMP)来并行化你的程序吗？如果不需要，把USER－OMP包删掉: make no-USER-OMP

如果你确实需要OpenMP，参照这个回答修改代码再重新编译。
http://lammps.sandia.gov/threads/msg41688.html

...

请问，我在调用USER-ATC的过程，添加了USER-ATC程序包，在~src进行make serial ,出现了错误，请问是什么原因，谢谢！
/usr/bin/ld: cannot find -latc
/usr/bin/ld: cannot find -lblas
/usr/bin/ld: cannot find -llapack
collect2: error: ld returned 1 exit status
Makefile:87: recipe for target '../lmp_serial' failed
make[1]: *** [../lmp_serial] Error 1
make[1]: Leaving directory '/home/wjf/lammps-30Oct14/src/Obj_serial'
Makefile:94: recipe for target 'serial' failed
make: *** [serial] Error 2
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10楼2014-12-16 16:03:37
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