24小时热门版块排行榜    

查看: 1440  |  回复: 0

sunjiamu

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助 团簇离子的能量计算

这个团簇离子的结构已经优化完成,想比较几个类似团簇离子的稳定性,但是能量的计算进行不下去了,求大神帮助,这种比较大的非共价体系(主要是氢键和ππ堆积)是否有合适的方法?

输入文件
% nprocshared=8
% mem=1000MB
# b3lyp/6-311g(d,p) freq=noraman
Title Card Required
2 1
O                  0.18605800    3.76283900    0.15583700
O                 -3.97339100    5.35241700   -0.84328500
C                 -2.80924200    5.60938400   -0.53165000
N                 -1.89294700    4.58051100   -0.31897400
C                 -0.56288000    4.72629400    0.00985100
N                 -0.15050700    6.02748300    0.15128000
C                 -0.99121700    7.09660800   -0.02930700
C                 -2.29576300    6.96150500   -0.36609000
O                  3.17960400    1.74901400    1.20382000
O                  2.52027900    6.25889200    0.94820800
C                  3.27856600    5.33340100    1.24400200
N                  2.87377100    4.01018100    1.08156700
C                  3.61521600    2.88838500    1.37107600
N                  4.86978200    3.14458900    1.86227700
C                  5.34787900    4.41762300    2.04873500
C                  4.62285800    5.52635000    1.76931800
O                  3.16333000   -2.04360800    0.74566300
O                  6.31988200    0.82366800    2.38369900
C                  6.02884300   -0.33021600    2.05856400
N                  4.76470500   -0.62241000    1.55159700
C                  4.30735600   -1.86097800    1.16013700
N                  5.23034400   -2.86925100    1.27751600
C                  6.49750500   -2.66512500    1.76342500
C                  6.94715400   -1.45362000    2.16599900
O                  0.05326800   -3.84706600   -0.41716600
O                  4.27244000   -5.36063800    0.44521000
C                  3.12856500   -5.62620600    0.06912200
N                  2.15812900   -4.62835300    0.00863500
C                  0.84914000   -4.78567200   -0.38612000
N                  0.51155200   -6.06538600   -0.74383900
C                  1.40831300   -7.10447900   -0.71770200
C                  2.69773900   -6.95680600   -0.33287000
O                 -3.13508000   -1.86751900   -1.01996200
O                 -2.13789700   -6.27967200   -1.64394900
C                 -2.97245200   -5.37761000   -1.74250600
N                 -2.65841700   -4.08099600   -1.33858700
C                 -3.48685500   -2.98419700   -1.40194800
N                 -4.72848700   -3.23604100   -1.92282300
C                 -5.12042200   -4.48449300   -2.33699800
C                 -4.31480600   -5.57015000   -2.27017800
O                 -3.05331500    1.95276500   -0.63245100
O                 -6.27143600   -0.91023600   -2.15878100
C                 -5.94277100    0.25313400   -1.91436100
N                 -4.69057000    0.53349800   -1.37001300
C                 -4.18639800    1.78283500   -1.07812700
N                 -5.05136000    2.81636300   -1.33684400
C                 -6.30089800    2.62653800   -1.86812100
C                 -6.79673100    1.40298100   -2.16961700
C                  0.31629500   -0.49766600   -1.07688200
C                 -0.01620600    0.18037400    0.25013400
C                 -0.77606500   -0.84486000    1.09190500
O                  1.40576400    0.15837000    3.88269200
O                  1.08616200    4.49740800    5.22753900
C                  1.75098200    3.46221000    5.23932200
N                  1.31690600    2.34791900    4.51901100
C                  1.90314700    1.11353800    4.49744500
N                  3.06394000    1.01104100    5.21038900
C                  3.58310600    2.06736100    5.92423000
C                  2.99733000    3.28687300    5.97240700
C                  3.53495500    4.44421600    6.76080300
O                 -1.23356900    2.56773200    3.37314400
O                 -5.56107800    3.90230100    3.73678000
C                 -4.38264000    4.17058400    3.96762300
N                 -3.37575100    3.32327700    3.50830000
C                 -2.03648500    3.42667600    3.76118600
N                 -1.66894800    4.53675400    4.47041900
C                 -2.59171500    5.44924100    4.93402400
C                 -3.92335400    5.33312300    4.71787300
C                 -4.94419100    6.30494900    5.23093800
O                 -4.15632900    0.85514400    2.55578200
O                 -6.70814200   -2.80343000    3.42752900
C                 -6.66612800   -1.57597200    3.33763600
N                 -5.48480600   -0.94835800    2.94995100
C                 -5.25790500    0.40050800    2.87799100
N                 -6.33644500    1.18267800    3.19504300
C                 -7.55179600    0.64626100    3.55814400
C                 -7.78304200   -0.68614200    3.62458000
C                 -9.09991600   -1.29048100    4.01258200
O                 -3.14373900   -2.53556200    3.02117400
O                 -0.89226600   -6.23552300    4.41731800
C                 -1.98885800   -5.72951400    4.17986400
N                 -2.05916000   -4.43572000    3.66391100
C                 -3.19038500   -3.70910000    3.42293200
N                 -4.36100500   -4.37218700    3.66153600
C                 -4.38896200   -5.66480900    4.13569400
C                 -3.27197400   -6.38178200    4.40277400
C                 -3.28385100   -7.78522600    4.93159700
O                  0.34513500   -3.13086100    3.38506600
O                  4.04277300   -1.65437800    5.55834500
C                  3.30917500   -2.61510500    5.31783400
N                  2.24913000   -2.46787100    4.42918400
C                  1.28986300   -3.39876200    4.13133300
N                  1.46378300   -4.61664500    4.73143800
C                  2.50691900   -4.86419200    5.59513900
C                  3.44488800   -3.93885500    5.91096500
C                  4.57864500   -4.18786300    6.86130600
O                 -1.64917400   -0.71194000   -3.84915300
O                 -3.77004300    3.06587400   -5.19228700
C                 -3.72124400    1.83616500   -5.26161100
N                 -2.79187100    1.13848700   -4.49690900
C                 -2.54822300   -0.20922500   -4.52602300
N                 -3.36666200   -0.92489800   -5.35835300
C                 -4.34013900   -0.32172300   -6.12204100
C                 -4.57212400    1.01345200   -6.11082800
C                 -5.61953200    1.68747300   -6.94730400
O                 -0.73105800    2.59827500   -3.25568600
O                  2.16350000    6.09259500   -3.66269000
C                  1.03567800    5.65758100   -3.88949200
N                  0.67280200    4.38903800   -3.43118900
C                 -0.51665600    3.75244300   -3.65421000
N                 -1.44129900    4.48146800   -4.34850300
C                 -1.17439800    5.74531900   -4.82584300
C                  0.00770600    6.37501300   -4.63111300
C                  0.32522600    7.74395600   -5.15548800
O                  2.77212100    2.84697700   -2.37048900
O                  7.11086600    1.52353000   -2.69813800
C                  6.31485700    2.45948500   -2.76482700
N                  4.96746500    2.24773900   -2.47339900
C                  3.95138900    3.15541100   -2.59030200
N                  4.34232300    4.41090700   -2.96522000
C                  5.65631200    4.72064100   -3.23833000
C                  6.66412200    3.82138900   -3.14774400
C                  8.09827400    4.13514000   -3.45468500
O                  4.15666800   -0.38973900   -2.32440500
O                  4.29026200   -4.41463300   -4.43346200
C                  4.93352000   -3.45873100   -3.99694900
N                  4.27764500   -2.42299100   -3.33769100
C                  4.83835000   -1.26770400   -2.86095300
N                  6.19373500   -1.17269700   -3.03654700
C                  6.92580800   -2.16060400   -3.65616900
C                  6.37614900   -3.30503200   -4.12682600
C                  7.15518100   -4.39366100   -4.80356400
O                  1.49458800   -2.34214300   -3.64528300
O                 -2.38448800   -3.61423200   -5.65225500
C                 -1.20671100   -3.89405800   -5.42031200
N                 -0.43615900   -3.04680100   -4.62826800
C                  0.89054200   -3.18197600   -4.32534700
N                  1.48162300   -4.30684700   -4.83332900
C                  0.79184800   -5.21212400   -5.60779300
C                 -0.51805300   -5.07442300   -5.92358700
C                 -1.28315800   -6.04724700   -6.77077400
H                 -2.23670300    3.61433600   -0.42026800
H                  0.83820300    6.16627100    0.41763900
H                 -0.52997000    8.06620300    0.11465400
H                  1.92350100    3.84885700    0.71538400
H                  5.44855000    2.31701300    2.08151100
H                  6.35662100    4.47168000    2.43992300
H                  4.11333900    0.16649200    1.43742600
H                  4.91966300   -3.80885100    0.98245400
H                  7.11730300   -3.55267400    1.80267100
H                  2.44780500   -3.67605500    0.27525100
H                 -0.46139500   -6.20729700   -1.05754100
H                  1.00579200   -8.06037100   -1.03004900
H                 -1.70854300   -3.92447400   -0.97229700
H                 -5.35796800   -2.42191400   -2.00021400
H                 -6.13081500   -4.53915200   -2.72328500
H                 -4.07251300   -0.26989300   -1.19156700
H                 -4.69832900    3.76706000   -1.14486100
H                 -6.86708500    3.53521900   -2.03278900
H                 -0.58320700   -0.87830400   -1.55957400
H                  1.01275000   -1.32160400   -0.93256200
H                 -0.63761600    1.06423200    0.08213000
H                  0.90085600    0.49761500    0.75536400
H                 -1.71721700   -1.11674500    0.61726900
H                 -0.19118700   -1.75160800    1.24115400
H                  0.42699600    2.44402900    4.00446600
H                  3.50491400    0.08019600    5.26773400
H                  4.50013200    1.84497000    6.45533400
H                  4.47072300    4.18244800    7.25671700
H                  3.71143000    5.30791600    6.11477100
H                  2.81702600    4.76201200    7.52142700
H                 -3.67166800    2.46506800    3.01730500
H                 -0.67091100    4.62748900    4.70781500
H                 -2.16943800    6.27113800    5.49875200
H                 -4.47237300    7.11911600    5.78285800
H                 -5.52436400    6.73144000    4.40862500
H                 -5.65682900    5.80483900    5.89194000
H                 -4.65624700   -1.54252700    2.80890200
H                 -6.16942500    2.19640000    3.25632700
H                 -8.31702500    1.37608100    3.79160700
H                 -9.83707800   -0.51857100    4.23814800
H                 -9.49166200   -1.91941500    3.20869600
H                 -8.98849900   -1.93304400    4.88948300
H                 -1.16123800   -3.95858100    3.48227700
H                 -5.24033600   -3.84978800    3.52130100
H                 -5.38289200   -6.06712000    4.28773300
H                 -4.30400800   -8.15087800    5.05706900
H                 -2.75305500   -8.46053400    4.25552300
H                 -2.77375300   -7.84038800    5.89672600
H                  2.06406300   -1.52588600    4.06194900
H                  0.71955800   -5.31188400    4.57794700
H                  2.51995900   -5.86223100    6.01530100
H                  4.55462500   -5.20864500    7.24538800
H                  5.54220700   -4.02394000    6.37181500
H                  4.53404400   -3.49759100    7.70757200
H                 -2.13306800    1.68428800   -3.92395600
H                 -3.16093800   -1.93033300   -5.44736300
H                 -4.91085200   -0.99825100   -6.74604300
H                 -6.17292700    0.96247400   -7.54591600
H                 -6.32877300    2.23302300   -6.31938600
H                 -5.16684500    2.41988400   -7.62061400
H                  1.39656500    3.84673200   -2.93393500
H                 -2.33887400    4.02422600   -4.57320500
H                 -1.98751800    6.19891400   -5.37875700
H                 -0.52514900    8.16746400   -5.69171600
H                  0.59654800    8.42083800   -4.34129600
H                  1.18129500    7.70975600   -5.83438700
H                  4.68129100    1.27861500   -2.26181500
H                  3.59550600    5.10231100   -3.12517100
H                  5.82445700    5.74662700   -3.54131300
H                  8.22248300    5.18254700   -3.73350200
H                  8.73621300    3.92622300   -2.59206300
H                  8.46420500    3.51175100   -4.27468700
H                  3.24839500   -2.45962900   -3.30652300
H                  6.62852300   -0.27437200   -2.78566600
H                  7.98487200   -1.95183700   -3.74318600
H                  8.21608300   -4.14517400   -4.85688600
H                  7.04696300   -5.34043900   -4.26784500
H                  6.78576100   -4.56198500   -5.81839200
H                 -0.89889100   -2.19715900   -4.26762100
H                  2.49217100   -4.42603300   -4.66048300
H                  1.38267200   -6.05039700   -5.95579700
H                 -0.64961300   -6.87542800   -7.09153500
H                 -2.13544800   -6.45490100   -6.22088300
H                 -1.68742200   -5.55501100   -7.65904100
C                  3.69760900   -8.07471300   -0.29990500
H                  4.54224800   -7.86136800   -0.96047200
H                  4.10837500   -8.20179800    0.70501000
H                  3.24453900   -9.01738700   -0.61072900
C                  8.32468300   -1.20609100    2.70586100
H                  8.84865100   -0.45516200    2.10892500
H                  8.27911700   -0.82092600    3.72800300
H                  8.91689900   -2.12260200    2.70818600
C                  5.12033200    6.92753500    1.97031800
H                  5.10419200    7.48677400    1.03128300
H                  4.48036300    7.47198800    2.66966500
H                  6.13995100    6.93116200    2.35892300
C                 -3.23113600    8.11545700   -0.57820600
H                 -3.64277400    8.10369700   -1.59093900
H                 -4.08198400    8.06043500    0.10577400
H                 -2.72206100    9.06799100   -0.42270200
C                 -8.15930100    1.16922800   -2.75232800
H                 -8.08919000    0.65031500   -3.71193900
H                 -8.76208500    0.53479900   -2.09719200
H                 -8.68881700    2.11097400   -2.90541500
C                 -4.72068000   -6.94422900   -2.71403600
H                 -4.06366600   -7.30724400   -3.50873200
H                 -4.64319800   -7.65942700   -1.89096300
H                 -5.74720400   -6.95116000   -3.08360400
H                 -1.62527500    0.55360300    2.44450300
H                 -1.70451400   -1.03885700    2.92748900
H                 -0.25296100   -0.17873200    3.02323600
N                 -1.11057100   -0.33488900    2.46615800
H                  1.22626800   -0.13551500   -2.88893500
H                  0.30593200    1.17117400   -2.40136000
H                  1.79687600    0.89960600   -1.73150600
N                  0.95187500    0.43048200   -2.07877600
输出文件部分内容
Standard basis: 6-311G(d,p) (5D, 7F)
There are  3330 symmetry adapted basis functions of A   symmetry.
Integral buffers will be 131072 words long.
Raffenetti 2 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned on.
3330 basis functions,  5632 primitive gaussians,  3479 cartesian basis functions
549 alpha electrons      549 beta electrons
nuclear repulsion energy     43750.6891149263 Hartrees.
NAtoms=  257 NActive=  257 NUniq=  257 SFac= 7.50D-01 NAtFMM=   80 NAOKFM=T Big=T
.....
FoFDir/FoFCou used for L=0 through L=2.
End of G2Drv Frequency-dependent properties file   721 does not exist.
End of G2Drv Frequency-dependent properties file   722 does not exist.
Internal input file was deleted!
Error termination via Lnk1e at Fri Dec 26 05:57:50 2013.
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

智能机器人

Robot (super robot)

我们都爱小木虫

找到一些相关的精华帖子,希望有用哦~

科研从小木虫开始,人人为我,我为人人
相关版块跳转 我要订阅楼主 sunjiamu 的主题更新
信息提示
请填处理意见