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漠梓

金虫 (小有名气)

[求助] 本人的CIF check出来很多问题,求大神庇佑已有1人参与

小弟最近在投一篇文章,编辑要求看晶体的checkcif文件,小弟在checkcif网站上检查了一下发现以下错误
Alert level A
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H1B    ..  H2A     ..       1.48 Ang.  
And 2 other PLAT417 Alerts
Less ...
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H2B    ..  H5A     ..       1.38 Ang.  
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H3C    ..  H4B     ..       1.09 Ang.  

PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .        350 Ang3  
Alert level B
CHEMW01_ALERT_1_B  The ratio of given/expected molecular weight as calculated
            from the _chemical_formula_sum lies outside
            the range 0.95 <> 1.05
            Calculated formula weight =   527.4510
            Formula weight given      =   498.4100
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H2B    ..  H5C     ..       2.04 Ang.  
小弟晶体精修只是几乎为零,不知类似错误该如何解决,求大神们不吝赐教
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546672286

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 漠梓 at 2013-12-30 09:29:59
大神 帮个忙吧,我木有你说的那个platon软件啊,我也不会那个操作,帮个忙吧...

最近比较忙,发过来我试试
9楼2013-12-30 11:34:49
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546672286

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
417 是由于氢的取向有问题
601 意思是你的结构中可能还有未解完全的组分,如溶剂,这个需要再解解。

建议等你把601处理完再处理别的错误吧
2楼2013-12-25 16:44:36
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漠梓

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 546672286 at 2013-12-25 16:44:36
417 是由于氢的取向有问题
601 意思是你的结构中可能还有未解完全的组分,如溶剂,这个需要再解解。

建议等你把601处理完再处理别的错误吧

这个是我们实验室往年发表过的晶体,现在没法再解了,我是根据CCDC号,从CCDC上下载下来的,没想到这么多AB类错误
3楼2013-12-25 16:57:22
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546672286

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 漠梓 at 2013-12-25 16:57:22
这个是我们实验室往年发表过的晶体,现在没法再解了,我是根据CCDC号,从CCDC上下载下来的,没想到这么多AB类错误...

那601错误就的用platon把空间挤掉
4楼2013-12-25 19:39:54
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