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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 本人的CIF check出来很多问题，求大神庇佑
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漠梓

金虫 (小有名气)

[求助] 本人的CIF check出来很多问题，求大神庇佑 已有1人参与

小弟最近在投一篇文章，编辑要求看晶体的checkcif文件，小弟在checkcif网站上检查了一下发现以下错误
Alert level A
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H1B    ..  H2A     ..       1.48 Ang.  
And 2 other PLAT417 Alerts
Less ...
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H2B    ..  H5A     ..       1.38 Ang.  
PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D       H3C    ..  H4B     ..       1.09 Ang.  

PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .        350 Ang3  
Alert level B
CHEMW01_ALERT_1_B  The ratio of given/expected molecular weight as calculated
            from the _chemical_formula_sum lies outside
            the range 0.95 <> 1.05
            Calculated formula weight =   527.4510
            Formula weight given      =   498.4100
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D       H2B    ..  H5C     ..       2.04 Ang.  
小弟晶体精修只是几乎为零，不知类似错误该如何解决，求大神们不吝赐教
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1楼 2013-12-25 16:16:44
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546672286

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 漠梓 at 2013-12-25 16:57:22
这个是我们实验室往年发表过的晶体，现在没法再解了，我是根据CCDC号，从CCDC上下载下来的，没想到这么多AB类错误...

那601错误就的用platon把空间挤掉
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2013-12-25 19:39:54
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
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546672286

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
417 是由于氢的取向有问题
601 意思是你的结构中可能还有未解完全的组分，如溶剂，这个需要再解解。

建议等你把601处理完再处理别的错误吧
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2013-12-25 16:44:36
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漠梓

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 546672286 at 2013-12-25 16:44:36
417 是由于氢的取向有问题
601 意思是你的结构中可能还有未解完全的组分，如溶剂，这个需要再解解。

建议等你把601处理完再处理别的错误吧

这个是我们实验室往年发表过的晶体，现在没法再解了，我是根据CCDC号，从CCDC上下载下来的，没想到这么多AB类错误
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3楼2013-12-25 16:57:22
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漠梓

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 546672286 at 2013-12-25 19:39:54
那601错误就的用platon把空间挤掉...

亲，您能帮我弄弄么 我把cif给你，
赞一下 回复此楼
5楼2013-12-25 19:52:33
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