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liangyan5240金虫 (著名写手)
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microRNA命名以及数据分析 已有1人参与
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| 我想请教一下这个miR-XX与miR-XX-3p（或5p)的区别，因为我做的芯片结果都是带3p或5p的，但是去pubmed查文献有miR-XX的结果，也有miR-XX-3P的结果，如果我想在论文讨论部分分析miR-XX-3P的话，可以引用miR-XX的文献吗？十分感谢！ |
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Davidzjy
铁杆木虫 (正式写手)
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【答案】应助回帖
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gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-12-21 16:09:55
liangyan5240: 金币+50, ★★★★★最佳答案, 十分感谢！ 2013-12-22 08:20:46
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"miR-xx与miR-xx-3p仅在基因组位置上邻近，其序列可以没有关系，种子序列也不同。可以认为是两个不同的miRNA。 可以在www.targetscan.org或miRbase.org上查找。 在miRbase上查找miR-xx，会将查找结果按基因座位的方式显示链接，点击进去后，miR-xx-5p 和 miR-xx-3p 的信息都在里面（如果都存在的话）。由于历史原因，有时候miR-xx先确定命名，然后才在基因组上座位上确定是miR-xx-5p还是miR-xx-3p，所以会存在miR-xx = miR-xx-3p的情况，这种情况在miRbase上都标注得很清楚。" ——引自XX园 最早在命名miRNA时 将已命名的miR-XX互补链上的miRNA称作miR-XX* 后来对microRNA命名进行规范后 将它们改成miR-XX-3p/-5p 因此你需要到数据库中 去查看你感兴趣miRNA的具体序列 确定文献中这个miRNA到底是指-3p还是-5p 要具体问题具体分析 不能一概而论 |
2楼2013-12-21 11:29:50
