| 查看: 561 | 回复: 1 | ||
liangyan5240金虫 (著名写手)
|
[求助]
microRNA命名以及数据分析 已有1人参与
|
| 我想请教一下这个miR-XX与miR-XX-3p（或5p)的区别，因为我做的芯片结果都是带3p或5p的，但是去pubmed查文献有miR-XX的结果，也有miR-XX-3P的结果，如果我想在论文讨论部分分析miR-XX-3P的话，可以引用miR-XX的文献吗？十分感谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
生物质炭与活化剂氢氧化钾混合注意事项
已经有0人回复
-
科研人必读：新一代 KRAS G12C 抑制剂 Olomorasib 的研究进展
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有176人回复
-
BT-11（Omilancor）研究化合物全解析：从分子结构到实验应用要点
已经有0人回复
-
富马酸贝达喹啉：二芳基喹啉类工具化合物的化学特征
已经有0人回复
-
BT投稿with editor状态快两周了，正常吗
已经有25人回复
-
Silevertinib（BDTX-1535）结构拆解：炔基双环片段为何成为合成瓶颈
已经有0人回复
-
RO4929097 解析：双苯并氮杂䓬骨架与 Notch 通路实验设计要点
已经有0人回复
-
分子量 1157 的 PROTAC 怎么配不析出：SGK3-PROTAC1 的溶解、分装与图谱复核
已经有0人回复
-
logP 6.1 的羧酸怎么配母液：GSK 650394 的溶解窗口与稀释顺序
已经有0人回复
-
从"水不溶"到 71 mg/mL：雷特格韦的 pH 依赖溶解与螯合色谱边界
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请教处理一系列时间命名的cav数据文件应该如何编写呢？
已经有10人回复
- microRNA靶标数据库和识别软件资源大全
已经有16人回复
- 有关microRNA的命名
已经有6人回复
Davidzjy
铁杆木虫 (正式写手)
- MolEPI: 3
- 应助: 209 (大学生)
- 金币: 6576.8
- 散金: 431
- 红花: 22
- 帖子: 971
- 在线: 394小时
- 虫号: 1887475
- 注册: 2012-07-11
- 专业: 人类遗传学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-12-21 16:09:55
liangyan5240: 金币+50, ★★★★★最佳答案, 十分感谢！ 2013-12-22 08:20:46
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-12-21 16:09:55
liangyan5240: 金币+50, ★★★★★最佳答案, 十分感谢！ 2013-12-22 08:20:46
|
"miR-xx与miR-xx-3p仅在基因组位置上邻近，其序列可以没有关系，种子序列也不同。可以认为是两个不同的miRNA。 可以在www.targetscan.org或miRbase.org上查找。 在miRbase上查找miR-xx，会将查找结果按基因座位的方式显示链接，点击进去后，miR-xx-5p 和 miR-xx-3p 的信息都在里面（如果都存在的话）。由于历史原因，有时候miR-xx先确定命名，然后才在基因组上座位上确定是miR-xx-5p还是miR-xx-3p，所以会存在miR-xx = miR-xx-3p的情况，这种情况在miRbase上都标注得很清楚。" ——引自XX园 最早在命名miRNA时 将已命名的miR-XX互补链上的miRNA称作miR-XX* 后来对microRNA命名进行规范后 将它们改成miR-XX-3p/-5p 因此你需要到数据库中 去查看你感兴趣miRNA的具体序列 确定文献中这个miRNA到底是指-3p还是-5p 要具体问题具体分析 不能一概而论 |
2楼2013-12-21 11:29:50
