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javacfish

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[交流] 如何大规模自动处理pdb文件为dock筛选

求哪位大侠，如何大规模自动处理pdb文件为dock筛选，用什么软件或什么有效的方法。

谢谢！

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1楼 2007-12-28 09:50:45

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javacfish

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引用回帖:

Originally posted by wjmed at 2007-12-28 20:27:

你的小分子是从那里来的？怎么是pdb格式的呢？
dock3.5以前的版本倒是将小分子输入格式作为pdb的。
后面的版本就都成为mol2了
如果想要转化，就写个循环脚本，用babel转化吧
脚本可以这样写：
########### ...

但是：babel 下载不了能否给我发一份，十分感谢！其他的软件包能否也提供一些？我的邮箱：paper_bai@yahoo.com.cn