24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 873  |  回复: 11
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

javacfish

金虫 (小有名气)

[交流] 如何大规模自动处理pdb文件为dock筛选

求哪位大侠,如何大规模自动处理pdb文件为dock筛选,用什么软件或什么有效的方法。

谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

★ ★
小红豆(金币+2,VIP+0):辛苦了!
有点儿乱,有点儿乱,
三千五......五千!
PDB是大分子的文件,对DOCK来说,有一个这样的文件也就够了。
需要筛选的是(五千个)小分子啊?难道这么多小分子存成了PDB?
这就如同《女王怀孕了?》,兼有政治、皇室、隐私、性和神秘之特色,
我们不禁要问:
这是谁干的?
3楼2007-12-28 10:11:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

montclimber

金虫 (正式写手)

我也想知道啊。不用转换成其他格式就可以Dock?惊讶
每天醒来都觉得不奔跑梦就要死了。
4楼2007-12-28 14:25:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

loappleve

金虫 (小有名气)


zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢您的参与,欢迎您常来计算模拟版解答问题。
我不太信任这样完全的自动化
还是自己手动放心
5楼2007-12-28 14:48:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

javacfish

金虫 (小有名气)

我说的是配体小分子的pdb格式转化为适合dock的文件格式,这可能是个小分子数据库。
6楼2007-12-28 19:43:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 282求调剂 +17 ycy1201 2026-04-01 19/950 2026-04-01 22:54 by peike
[考研] 材料调剂 +14 一样YWY 2026-04-01 14/700 2026-04-01 21:07 by lijunpoly
[考研] 316求调剂 +9 舟自梗 2026-04-01 10/500 2026-04-01 18:13 by 无际的草原
[考研] 0710生物学考研调剂 +3 李多米lee. 2026-03-27 4/200 2026-04-01 16:21 by zzchen2000
[考研] 08工科275分求调剂 +12 AaAa7420 2026-03-31 12/600 2026-04-01 15:45 by jp9609
[考研] 302求调剂一志愿北航070300,本科郑大化学 +8 圣日耳曼条 2026-04-01 10/500 2026-04-01 14:03 by ZXlzxl0425
[考研] 262求调剂 +9 励志一定发文章 2026-03-31 10/500 2026-04-01 12:22 by sunshine0013
[考研] 一志愿北交材料工程总分358 +5 cs0106 2026-04-01 7/350 2026-04-01 11:45 by wangjy2002
[考研] 311求调剂一志愿合肥工业大学 +14 秋二十二 2026-03-30 14/700 2026-04-01 11:45 by chemdavid
[考研] 材料专业求调剂 +7 月月鸟木 2026-04-01 7/350 2026-04-01 11:36 by wangjy2002
[考研] 314求调剂 +6 1xiaojun23 2026-03-31 6/300 2026-04-01 11:28 by 今天星期八LQ
[考研] 070300求调剂306分 +5 26要上岸 2026-03-27 5/250 2026-04-01 11:09 by oooqiao
[考研] 一志愿 南京航空航天大学 ,080500材料科学与工程学硕 +10 @taotao 2026-03-31 11/550 2026-04-01 09:43 by xiayizhi
[考研] 一志愿南师大0703化学 275求调剂 +5 Ripcord上岸 2026-03-27 5/250 2026-03-31 19:52 by mg1014
[考研] 297 地理学070500 复试求调剂 +3 小圆圈圈ooo 2026-03-30 3/150 2026-03-30 21:05 by 余震yz
[考研] 311求调剂 +10 lin0039 2026-03-26 10/500 2026-03-30 10:26 by herarysara
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +6 崔wj 2026-03-26 6/300 2026-03-29 01:11 by hanserlol
[考研] 085405 考的11408求各位老师带走 +3 Qiu学ing 2026-03-28 3/150 2026-03-28 09:19 by 乐呵呵的追梦人
[考研] 315调剂 +4 0860求调剂 2026-03-26 5/250 2026-03-27 11:23 by wangjy2002
[考研] 打过很多竞赛,085406控制工程300分,求调剂 +3 askeladz 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:08 by 给你你注意休息
信息提示
请填处理意见