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甲斐之虎

银虫 (正式写手)

[求助] 求教：关于PDOS的处理

如题，使用PAW-PBE泛函，在使用LORBIT=11计算PDOS以后，可以用DOS-split来处理态密度吗？
听有人说，DOS-split只能用来处理超软计算出来的态密度？
如果不能用DOS-split处理，那么有什么小程序可以用来处理PDOS呢？
请各位大侠指教！
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别人笑我太疯颠，我笑他人看不穿。不见五陵豪杰墓，无花无酒锄作田。
1楼 2013-12-06 12:24:50
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

枫羽IMR

金虫 (正式写手)
★ ★
fzx2008: 金币+2, 谢谢回帖！ 2013-12-06 15:53:09
引用回帖:
3楼: Originally posted by 甲斐之虎 at 2013-12-06 13:10:12
前辈，我好想说的不清楚，
对于出现spd轨道那种，是PDOS还是TDOS？
对于px py pz那种，是PDOS还是TODS？
另外，DOS-split只能用来处理超软计算出来的态密度？
请前辈赐教...

态密度（DOS）分析就是将总态密度（TDOS）分解为各个原子的各个轨道（PDOS），它的前提假设是体系中的每个电子状态的轨道是由组成它的各个原子的各个轨道按一定比例混合得到的，态密度分析就是其逆过程。你好像是想分析原子轨道（s、px、py、pz和d轨道）是如何相互作用形成分子轨道或晶体轨道，这些都是通过PDOS来分析的。DOS-split只能用来处理超软计算出来的态密度，为什么，这句话我没听说过。
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4楼2013-12-06 13:42:30
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枫羽IMR

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 甲斐之虎 at 2013-12-06 21:23:20
前辈：
“DOS-split只能用来处理超软计算出来的态密度，为什么，这句话我没听说过。”
这句话也是别人问我的，吓了一跳，我也没听过……
前辈，我是看到文献里有两种态密度分析，一种是s p d，另一种是
s、px、 ...

DOS-split只能用来处理超软计算出来的态密度，我也不确认，需要再查证一下，搞清楚出处和理由。
我觉得你指的两种态密度分析，可能是一种是基于原子轨道的，就是s p d，s px py pz...也是属于这种，px py pz是按取向把p轨道分得更细了；另一种是基于成键类型，如σ、π轨道。
建议读下这篇文献
A chemical and theoretical way to look at bonding on surfaces, Roald Hoffmann, 1988, Reviews of Modern Physics. 把一些概念搞清楚。
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6楼2013-12-08 08:48:22
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枫羽IMR

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
甲斐之虎: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-12-06 13:10:18
liliangfang: 金币+3, 谢谢指教 2013-12-08 07:39:59
可以将计算得到的vasprun.xml文件导入p4vasp，在里面的Electronic选项下可以显示并导出PDOS数据，然后可以将PDOS数据导入Origin作图
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2楼2013-12-06 12:47:14
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枫羽IMR

金虫 (正式写手)
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-12-09 21:46:53
引用回帖:
7楼: Originally posted by 甲斐之虎 at 2013-12-08 11:14:37
首先多謝前輩指教
Roald Hoffmann，一直想讀讀他寫的那本書，但是一直也沒倒出空，唉
我前面好像是說錯了，我一直不太清楚LDOS與PDOS的區別，感覺LDOS就是spd那種，PDOS就是s px py pz那種，不知道這麼理解對不對 ...

不客气，我做这个也没多久。
那篇Review也不用一次全读完，可以一段一段的理解，并且也不是读一遍就马上全明白的，每隔断时间就要重新拿出来看看，可能会有新的理解。
论坛上有PDOS和LDOS的区别的讨论：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2168825&fpage=1，可以参考下
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8楼2013-12-08 12:48:37
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甲斐之虎

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 枫羽IMR at 2013-12-06 12:47:14
可以将计算得到的vasprun.xml文件导入p4vasp，在里面的Electronic选项下可以显示并导出PDOS数据，然后可以将PDOS数据导入Origin作图

前辈，我好想说的不清楚，
对于出现spd轨道那种，是PDOS还是TDOS？
对于px py pz那种，是PDOS还是TODS？
另外，DOS-split只能用来处理超软计算出来的态密度？
请前辈赐教
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3楼2013-12-06 13:10:12
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甲斐之虎

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 枫羽IMR at 2013-12-06 13:42:30
态密度（DOS）分析就是将总态密度（TDOS）分解为各个原子的各个轨道（PDOS），它的前提假设是体系中的每个电子状态的轨道是由组成它的各个原子的各个轨道按一定比例混合得到的，态密度分析就是其逆过程。你好像是想 ...

前辈：
“DOS-split只能用来处理超软计算出来的态密度，为什么，这句话我没听说过。”
这句话也是别人问我的，吓了一跳，我也没听过……
前辈，我是看到文献里有两种态密度分析，一种是s p d，另一种是
s、px、py、pz……，就是不知道这两种的名称各叫什么，好像都叫混了，感觉……
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5楼2013-12-06 21:23:20
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甲斐之虎

银虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 枫羽IMR at 2013-12-08 08:48:22
DOS-split只能用来处理超软计算出来的态密度，我也不确认，需要再查证一下，搞清楚出处和理由。
我觉得你指的两种态密度分析，可能是一种是基于原子轨道的，就是s p d，s px py pz...也是属于这种，px py pz是按取 ...

首先多謝前輩指教
Roald Hoffmann，一直想讀讀他寫的那本書，但是一直也沒倒出空，唉
我前面好像是說錯了，我一直不太清楚LDOS與PDOS的區別，感覺LDOS就是spd那種，PDOS就是s px py pz那種，不知道這麼理解對不對，請前輩指教
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别人笑我太疯颠，我笑他人看不穿。不见五陵豪杰墓，无花无酒锄作田。
7楼2013-12-08 11:14:37
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甲斐之虎

银虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 枫羽IMR at 2013-12-08 12:48:37
不客气，我做这个也没多久。
那篇Review也不用一次全读完，可以一段一段的理解，并且也不是读一遍就马上全明白的，每隔断时间就要重新拿出来看看，可能会有新的理解。
论坛上有PDOS和LDOS的区别的讨论：http://e ...

前輩謙虛了
這個帖子我看過，前輩，這段話寫的很好：
我认为PDOS指的是投影或者分波态密度，projected or partial density of states. 意思是投影到轨道的态密度，LDOS指的是局域态密度，可以是单原子的，也可以是某个区域所有原子的，取决于你想分析什么性质。同样的，PDOS也同样可以有LDOS，即每个原子的投影态密度，或者所有原子的投影态密度。
另外小木蟲中所有關於PDOS和LDOS的帖子也看過很多，文獻有時候叫不同的說法，給人說糊塗了……
前輩一定看過Hoffmann的那本書吧，我最近買了，瀏覽了一下，感覺相當不錯
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别人笑我太疯颠，我笑他人看不穿。不见五陵豪杰墓，无花无酒锄作田。
9楼2013-12-08 12:59:53
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枫羽IMR

金虫 (正式写手)
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-12-09 21:47:14
引用回帖:
9楼: Originally posted by 甲斐之虎 at 2013-12-08 12:59:53
前輩謙虛了
這個帖子我看過，前輩，這段話寫的很好：
我认为PDOS指的是投影或者分波态密度，projected or partial density of states. 意思是投影到轨道的态密度，LDOS指的是局域态密度，可以是单原子的，也可 ...

可以这么理解，PDOS偏重于原子轨道的组分，LDOS偏重于空间分布。文献中的不一定是对的，需要自己分辨。
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10楼2013-12-08 13:10:12
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