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51jiankang

铜虫 (小有名气)

[求助] 微生物没鉴定可以发文章吗

利用从土壤中分离的混合微生物做了一些实验,取得了一些数据,但是如果没有鉴定这些微生物,对里面的微生物种类一无所知,这样的结果能发文章吗?
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51jiankang

铜虫 (小有名气)

大家有过这种经验吗?
2楼2013-12-09 04:04:47
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励应助! 2013-12-09 09:21:07
51jiankang: 金币+10 2013-12-09 13:32:01
51jiankang: 金币+5 2013-12-13 02:09:21
51jiankang: 金币+5 2013-12-17 04:45:33
以前见过。如果数据比较好,如果和微生物种类关系不大,应该还可以吧。但是,最好鉴定一下种类吧,混合样品16s或ITS测序,一个样品1千多块钱。
做一个阳光、开朗的小和尚
3楼2013-12-09 08:28:22
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entoloma

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
51jiankang: 金币+5 2013-12-09 13:32:16
51jiankang: 金币+5 2013-12-13 02:09:29
一般情况下药鉴定的,如果根源都不清楚,结果会比较麻烦。
4楼2013-12-09 08:54:29
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51jiankang

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhaozhibozhi at 2013-12-09 08:28:22
以前见过。如果数据比较好,如果和微生物种类关系不大,应该还可以吧。但是,最好鉴定一下种类吧,混合样品16s或ITS测序,一个样品1千多块钱。

我是混合样品,不知道里面有哪些微生物,请问混合样品16s或ITS测序用什么手段,本人咨询测序公司他们建议Illumina的MiSeq,但报价好贵
5楼2013-12-09 13:35:02
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 51jiankang at 2013-12-09 13:35:02
我是混合样品,不知道里面有哪些微生物,请问混合样品16s或ITS测序用什么手段,本人咨询测序公司他们建议Illumina的MiSeq,但报价好贵...

454焦磷酸测序比较常用,因为读长较长;当然其它测序方法也有人用。一般的测序公司都行。前几天遇到一个北京诺禾致源高通量测序的,说一个样品1500,20个样品以上1000元/个,忘了他们用什么方法了。
做一个阳光、开朗的小和尚
6楼2013-12-10 08:53:22
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dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
51jiankang: 金币+5 2013-12-11 05:55:31
51jiankang: 金币+5 2013-12-13 02:09:52
诺禾致源最近几年发展的还不错,楼主什么环境的啊,虽然是混合,那也要看样品啊,如果是发酵罐里的几株菌,搞454不是浪费么,分离纯化鉴定即可
7楼2013-12-10 09:10:54
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deguohan

至尊木虫 (职业作家)

教授、博/硕导

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
51jiankang: 金币+5 2013-12-11 05:56:29
51jiankang: 金币+5 2013-12-13 02:09:59
如果数据比较好,并且和微生物种类关系不大的论文应该还可以发吧。但是,最好鉴定一下种类吧,鉴定完发大文章!!!!!!!!!
天道酬勤,厚德载物
8楼2013-12-10 09:46:25
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51jiankang

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by dllchina at 2013-12-10 09:10:54
诺禾致源最近几年发展的还不错,楼主什么环境的啊,虽然是混合,那也要看样品啊,如果是发酵罐里的几株菌,搞454不是浪费么,分离纯化鉴定即可

的确是发酵罐里做的,现在就是不知道发酵罐到底有多少微生物,因为是直接利用从土壤中分离的微生物做的,对里面的微生物菌群一无所知,所以也很犹豫,如果里面菌数不多,用高通量测序的话确有点浪费。
9楼2013-12-11 12:14:59
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