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从PDB数据库中下载的四聚体只有一个亚基，应该如何下载其它三个亚基的信息
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| 分子对接还没有入门。想进行分子对接时，从PDB数据库中下载的1YHB蛋白应该是个四聚体，可是我下载的数据只是一个亚基。因为药物结合的活性位点在两个亚基之间，因此，想得到两个相邻的亚基的数据，不知道怎么下载，或则下载后在DS软件中如何对称操作。非常感谢！ |
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月只蓝: 金币+3, 感谢指导！ 2013-11-30 10:15:04
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月只蓝: 金币+3, 感谢指导！ 2013-11-30 10:15:04
| 的确是一个亚基，在寻找自己需要的蛋白晶体结构(一个蛋白通常会有多个晶体结构，而且这些结构往往是满足某一蛋白的特性，比如你现在要找的毗邻亚基之间的活性位点，蛋白与小分子结合的晶体复合物等)，一定注意要多阅读PDB文件描述，之前走过很多弯路，越显而易见的越容易忽略。这个蛋白是包含了2个点突变（Y41H and Y41F）Ff噬菌体基因V蛋白。 希望对你有用 |
2楼2013-11-29 18:31:20
yaozhq
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3楼2013-11-30 13:13:33