24小时热门版块排行榜    

查看: 1930  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

liu_chen_na

新虫 (初入文坛)


[交流] 用AutoDock4.2对接准备受体蛋白时为什么要除水?

RT,刚接触这块,很多基本东西不了解啊
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuhaigang

木虫 (著名写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个你要对比要不要去除水。两个对比一下不就知道水对你的结果影响了啊,不过,因为每个蛋白质的结晶状态不一样,不一定要保留水,毕竟AD认为他们对接的构象,跟真实构象一样。自己慢慢考虑吧
8楼2013-11-17 13:49:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

longytu

捐助贵宾 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★
liu_chen_na(金币+1): 谢谢参与
liu_chen_na: 金币+2 2013-11-14 09:01:07
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2013-11-14 09:09:53
liu_chen_na: 金币+2 2013-11-14 11:51:11
结晶水会影响配体与靶蛋白的相互作用
4楼2013-11-14 08:07:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liu_chen_na

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
4楼: Originally posted by longytu at 2013-11-14 08:07:41
结晶水会影响配体与靶蛋白的相互作用

继续问,那糖基化的侧链和一些离子需不需要处理啊
5楼2013-11-14 09:02:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yaozhq

金虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★
liu_chen_na(金币+1): 谢谢参与
liu_chen_na: 金币+2 2013-11-14 11:50:56
月只蓝: 金币+2, 感谢指导! 2013-11-15 09:47:21
引用回帖:
5楼: Originally posted by liu_chen_na at 2013-11-14 09:02:11
继续问,那糖基化的侧链和一些离子需不需要处理啊...

只要是占据空间的原子 都会在对接的时候影响配体的结合 除非你觉得这个东西就在着应该发生作用 否则一律删除
6楼2013-11-14 11:16:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +5 瞬息宇宙 2026-09-01 11/550 2026-09-02 14:15 by simwe390
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 10/500 2026-09-02 11:35 by 大不刘6
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +5 瞬息宇宙 2026-08-31 5/250 2026-09-02 10:13 by 雨冰共舞
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 8/400 2026-09-02 02:42 by Leogzhya
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
信息提示
请填处理意见