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用AutoDock4.2对接准备受体蛋白时为什么要除水?
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liu_chen_na
新虫
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[交流]
用AutoDock4.2对接准备受体蛋白时为什么要除水?
RT,刚接触这块,很多基本东西不了解啊
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1楼
2013-11-13 22:01:36
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xufund
至尊木虫
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虫号: 311488
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
在HIV-1蛋白酶的设计中,水分子不是很重要的吗?请问对这样一类受体怎么处理?需要删除的是哪些水分子?
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7楼
2013-11-15 22:05:22
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longytu
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★ ★ ★ ★ ★ ★
liu_chen_na(金币+1): 谢谢参与
liu_chen_na: 金币+2
2013-11-14 09:01:07
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流!
2013-11-14 09:09:53
liu_chen_na: 金币+2
2013-11-14 11:51:11
结晶水会影响配体与靶蛋白的相互作用
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4楼
2013-11-14 08:07:41
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liu_chen_na
新虫
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引用回帖:
4楼
:
Originally posted by
longytu
at 2013-11-14 08:07:41
结晶水会影响配体与靶蛋白的相互作用
继续问,
那糖基化的侧链和一些离子需不需要处理啊
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5楼
2013-11-14 09:02:11
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yaozhq
金虫
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在线: 37.6小时
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★ ★ ★ ★ ★
liu_chen_na(金币+1): 谢谢参与
liu_chen_na: 金币+2
2013-11-14 11:50:56
月只蓝: 金币+2, 感谢指导!
2013-11-15 09:47:21
引用回帖:
5楼
:
Originally posted by
liu_chen_na
at 2013-11-14 09:02:11
继续问,
那糖基化的侧链和一些离子需不需要处理啊...
只要是占据空间的原子 都会在对接的时候影响配体的结合 除非你觉得这个东西就在着应该发生作用 否则一律删除
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6楼
2013-11-14 11:16:45
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