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漫天雪涯

铜虫 (初入文坛)

[求助] 怎样对一个酶进行同源建模,能分析出合理的突变位点 已有3人参与

求助/(ㄒoㄒ)/~~
我在做酶的定点突变,现在要同源建模,来寻找突变位点。
但是SWISS模拟出来的结果好奇怪,300aa的氨基酸模拟出来变成500+aa了,而且我完全不知道怎么分析?
求各位指导一下。是不是有别的同源建模的方法,可以分析出突变位点。
ヾ(≧O≦)〃实验室就我一个人做这个,都木有交流的人,好可怜嘤嘤嘤……
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漫天雪涯

铜虫 (初入文坛)

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3楼: Originally posted by ferlich at 2013-11-14 14:28:50
对于同源模建,你需要寻找与你序列同源性高的蛋白晶体结构,你的序列和晶体结构的同源性高的话,同源模建的结果才有意义

可是找不到相似度特别高的已结晶蛋白/(ㄒoㄒ)/~~
4楼2013-11-15 09:36:46
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漫天雪涯

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by JAYWEN书生 at 2014-01-02 15:06:19
我就在做这个,可以交流

我在做一个酶的点突变,希望提高酶活。但是用SWISS和I-TASSER模拟出来效果都不是很好/(ㄒoㄒ)/~~
7楼2014-01-02 21:27:05
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漫天雪涯

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by JAYWEN书生 at 2014-01-07 16:20:12
可以看一下你的序列和模拟结果,I-TASSER根据二级结构和三维结构改造,可以在螺旋上减小侧链,也可以在折叠上设计盐桥...

我的蛋白就是活性中心基本已知,但是同源建模的话同源蛋白很少,同源性不超过30%。。。我想就在活性中心附近改造一下看看,这样应该会好一点吧(⊙_⊙)?
9楼2014-01-09 14:34:26
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