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limengru

新虫 (小有名气)

[求助] 关于考虑溶剂中优化时的溶剂分子的处理

请教下，对于分子在溶剂中的优化时，是在输入构型的时候添加溶剂分子还是直接在gjf文件中添加Solvent=**的关键字，还是两者都需要？什么时候用哪种方法比较好？两种方法有什么区别？
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@lyjoy

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1楼 2013-11-05 15:13:16
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sujialing

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2013-11-05 16:34:09
额，我记得高斯的说明书里有介绍这部分吧，采用关键字控制
scrf=(smd,solvent=""
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越努力，越幸运！
2楼2013-11-05 16:01:37
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+1 2013-11-05 16:34:16
用solvent=**就可以了，默认是水。
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3楼2013-11-05 16:23:35
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limengru

新虫 (小有名气)
内容已删除
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4楼2013-11-05 16:32:35
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marson

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-11-06 21:33:21
scrf=(pcm,solvent=water)~输入文件中这种命令体现的是一个溶剂效应，相当于加了一个力场来体现溶剂的作用~但是这种命令体现不出水的催化参与反应的作用，所以有些文献局部加了水分子来体现这种作用~
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思想有多远，我们就能走多远~
5楼2013-11-05 22:17:49
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sujialing

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by limengru at 2013-11-05 16:32:35
不用在输入构型中添加溶剂分子吗？为什么有的文献的结构图中加入了溶剂分子？...

大多数情况下是不用加的。
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越努力，越幸运！
6楼2013-11-06 08:44:06
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limengru

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by marson at 2013-11-05 22:17:49
scrf=(pcm,solvent=water)~输入文件中这种命令体现的是一个溶剂效应，相当于加了一个力场来体现溶剂的作用~但是这种命令体现不出水的催化参与反应的作用，所以有些文献局部加了水分子来体现这种作用~

那什么时候需要加水分子
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7楼2013-11-06 14:30:15
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marson

银虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by limengru at 2013-11-06 14:30:15
那什么时候需要加水分子...

参与反应或者与实验不吻合时可以考虑加水分子~
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思想有多远，我们就能走多远~
8楼2013-11-06 16:48:58
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