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limengru

新虫 (小有名气)

[求助] 关于考虑溶剂中优化时的溶剂分子的处理

请教下,对于分子在溶剂中的优化时,是在输入构型的时候添加溶剂分子还是直接在gjf文件中添加Solvent=**的关键字,还是两者都需要?什么时候用哪种方法比较好?两种方法有什么区别?
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sujialing

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2013-11-05 16:34:09
额,我记得高斯的说明书里有介绍这部分吧,采用关键字控制
scrf=(smd,solvent=""
越努力,越幸运!
2楼2013-11-05 16:01:37
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+1 2013-11-05 16:34:16
用solvent=**就可以了,默认是水。
3楼2013-11-05 16:23:35
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limengru

新虫 (小有名气)

内容已删除
4楼2013-11-05 16:32:35
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marson

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+2 2013-11-06 21:33:21
scrf=(pcm,solvent=water)~输入文件中这种命令体现的是一个溶剂效应,相当于加了一个力场来体现溶剂的作用~但是这种命令体现不出水的催化参与反应的作用,所以有些文献局部加了水分子来体现这种作用~
思想有多远,我们就能走多远~
5楼2013-11-05 22:17:49
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sujialing

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by limengru at 2013-11-05 16:32:35
不用在输入构型中添加溶剂分子吗?为什么有的文献的结构图中加入了溶剂分子?...

大多数情况下是不用加的。
越努力,越幸运!
6楼2013-11-06 08:44:06
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limengru

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by marson at 2013-11-05 22:17:49
scrf=(pcm,solvent=water)~输入文件中这种命令体现的是一个溶剂效应,相当于加了一个力场来体现溶剂的作用~但是这种命令体现不出水的催化参与反应的作用,所以有些文献局部加了水分子来体现这种作用~

那什么时候需要加水分子
7楼2013-11-06 14:30:15
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marson

银虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by limengru at 2013-11-06 14:30:15
那什么时候需要加水分子...

参与反应或者与实验不吻合时可以考虑加水分子~
思想有多远,我们就能走多远~
8楼2013-11-06 16:48:58
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