24小时热门版块排行榜    

查看: 2806  |  回复: 17

身在长沙

新虫 (初入文坛)

[求助] NEB的计算出现负值,测试的其他能量都比初始的00和终止的10低

问题如下:
1.计算NEB的方法:首先利用nebmake.pl产生初始终态结构,用xcrysden查看了路径没问题,然后对初始终态结构进行几何结构优化,接着采用优化后的能量构型进行NEB的计算,按照VASP manual上说明,在INCAR中设置如下:
ISTART = 0; ICHARG = 2
   ENCUT  = 400
   ISMEAR = 2
   LREAL=Auto
NELM=200
NSW=1000
EDIFFG=-0.02
LWAVE = F
LCHARG = F
ICHAIN=0
IMAGES=9
SPRING=-5
LCLIMB=.TRUE.
IBRION=3
POTIM=0
IOPT=7
算完之后用nebbarrier.pl产生的neb.dat如下:
0     0.000000     0.000000     0.000000   0
  1     0.151183    -2.145471    -0.242258   1
  2     0.302705    -2.106921    -0.362263   2
  3     0.452469    -2.051050    -0.403422   3
  4     0.603020    -2.012050    -0.282203   4
  5     0.753502    -1.992645     0.000084   5
  6     0.904120    -2.012146     0.253874   6
  7     1.054939    -2.051164     0.407455   7
  8     1.204729    -2.107090     0.352265   8
  9     1.356227    -2.145477     0.236853   9
10     1.507559     0.000000     0.000000  10
初末位置的能量我多次验算都是最低的,不知道是什么原因,求大神们不吝指教我这个新手!谢谢啦
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

liu-biao

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
求楼下解决  我也遇到了 大神们 求支援
2楼2013-11-04 12:16:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
identation: 金币+1, 谢谢交流 2013-11-04 13:53:17
你把03这个结构拿出来 做一下结构优化,看看是否能够回到00结构
不能的话,就是你初始结构没找对,也就是说没有找到能量最低结构
3楼2013-11-04 12:43:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

身在长沙

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by emilyoyang at 2013-11-04 12:43:21
你把03这个结构拿出来 做一下结构优化,看看是否能够回到00结构
不能的话,就是你初始结构没找对,也就是说没有找到能量最低结构

谢谢你的回复,这个我做过了,弛豫之后又回到00结构了。而且我做到这个构型的能量最低位置与文献上的是一致的。我怀疑是参数设置那里出了问题,麻烦你再帮我看看。新手上路,请多多指教啊!
4楼2013-11-04 13:10:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-11-04 16:22:20
参数没什么大的问题
NELM=200 默认的60就行了  不用这么大
IOPT=7 最好用 1  我一般用1 3
IMAGES=9 这么多干嘛 反应路径很长吗  9images的话计算量会很大
方便的话可以把你的initial和final POSCAR贴出来  我看看
5楼2013-11-04 16:07:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zjh-111

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2013-11-04 16:22:29
我的感觉是nebbarrier.pl的脚本的问题,因为我之前跑NEB的时候就发现脚本各种错误,我觉得只要你确定初终态是正确的,过渡态符合常理就可以了

[ 发自小木虫客户端 ]

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

6楼2013-11-04 16:13:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

身在长沙

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by emilyoyang at 2013-11-04 16:07:14
参数没什么大的问题
NELM=200 默认的60就行了  不用这么大
IOPT=7 最好用 1  我一般用1 3
IMAGES=9 这么多干嘛 反应路径很长吗  9images的话计算量会很大
方便的话可以把你的initial和final POSCAR贴出来  我看 ...

谢谢你的回复,我的初末位置弛豫用的INCAR都是如下的
SYSTEM =W-bcc
ENCUT = 400
ISTART = 0 ; ICHARG = 2
ISMEAR = 2
NSW = 100 ; IBRION =2
ISIF = 2
EDIFF = 1E-04 ; EDIFFG = -1E-02
LREAL= Auto
PREC = Accurate
虚心求指导!
7楼2013-11-04 16:37:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

身在长沙

新虫 (初入文坛)

内容已删除
8楼2013-11-04 16:49:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zjh-111

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 身在长沙 at 2013-11-04 16:49:32
我的计算脚本都是师兄师姐用过留下来的,这让我怎么搞啊?还有这个脚本最新的你知道在哪里下载吗?  麻烦你了...

嗯,我都是自己写,你可以上官网下个最新的看看,要么你那个脚本贴出来给我看看
一般情况我觉得问题不大,很可能就是把负号当正号就行了

[ 发自小木虫客户端 ]
9楼2013-11-04 18:40:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zjh-111

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

内容已删除
10楼2013-11-04 18:42:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 身在长沙 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 招08考数学 +4 laoshidan 2026-03-20 8/400 2026-03-22 19:56 by 小皮蛋酱
[考研] 环境学硕288求调剂 +6 皮皮皮123456 2026-03-22 6/300 2026-03-22 16:52 by i_cooler
[考研] 寻找调剂 +4 倔强芒? 2026-03-21 4/200 2026-03-22 16:14 by 木托莫露露
[考研] 一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂 +3 vv迷 2026-03-22 3/150 2026-03-22 15:18 by 杨杨杨紫
[考研] 269专硕求调剂 +6 金恩贝 2026-03-21 6/300 2026-03-22 14:31 by ColorlessPI
[考研] 0805 316求调剂 +3 大雪深藏 2026-03-18 3/150 2026-03-21 18:55 by 学员8dgXkO
[考研] 工科0856求调剂 +3 沐析汀汀 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:30 by 学员8dgXkO
[考研] 297求调剂 +11 戏精丹丹丹 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:47 by ColorlessPI
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +5 纸鱼ly 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:11 by 学员8dgXkO
[考研] 307求调剂 +3 wyyyqx 2026-03-17 3/150 2026-03-21 03:20 by JourneyLucky
[考研] 材料工程(专)一志愿985 初试335求调剂 +3 hiloiy 2026-03-17 4/200 2026-03-21 03:04 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工 +8 安全上岸! 2026-03-16 8/400 2026-03-20 22:13 by luoyongfeng
[考研] 求调剂一志愿南京航空航天大学289分 +3 @taotao 2026-03-19 3/150 2026-03-20 21:34 by JourneyLucky
[考研] A区线材料学调剂 +5 周周无极 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:33 by laoshidan
[考研] 295材料求调剂,一志愿武汉理工085601专硕 +5 Charlieyq 2026-03-19 5/250 2026-03-20 20:35 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕 +5 @taotao 2026-03-20 5/250 2026-03-20 20:16 by JourneyLucky
[考博] 申博26年 +3 八6八68 2026-03-19 3/150 2026-03-19 19:43 by nxgogo
[考研] 085601材料工程专硕求调剂 +10 慕寒mio 2026-03-16 10/500 2026-03-19 15:26 by 丁丁*
[考研] 材料,纺织,生物(0856、0710),化学招生啦 +3 Eember. 2026-03-17 9/450 2026-03-18 10:28 by Eember.
[考研] 283求调剂 +3 听风就是雨; 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:41 by 热情沙漠
信息提示
请填处理意见