应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » NEB的计算出现负值，测试的其他能量都比初始的00和终止的10低
51/1返回列表
查看: 3603  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

身在长沙

新虫 (初入文坛)

[求助] NEB的计算出现负值，测试的其他能量都比初始的00和终止的10低

问题如下：
1.计算NEB的方法：首先利用nebmake.pl产生初始终态结构，用xcrysden查看了路径没问题，然后对初始终态结构进行几何结构优化，接着采用优化后的能量构型进行NEB的计算，按照VASP manual上说明，在INCAR中设置如下：
ISTART = 0; ICHARG = 2
   ENCUT  = 400
   ISMEAR = 2
   LREAL=Auto
NELM=200
NSW=1000
EDIFFG=-0.02
LWAVE = F
LCHARG = F
ICHAIN=0
IMAGES=9
SPRING=-5
LCLIMB=.TRUE.
IBRION=3
POTIM=0
IOPT=7
算完之后用nebbarrier.pl产生的neb.dat如下：
0     0.000000     0.000000     0.000000   0
  1     0.151183    -2.145471    -0.242258   1
  2     0.302705    -2.106921    -0.362263   2
  3     0.452469    -2.051050    -0.403422   3
  4     0.603020    -2.012050    -0.282203   4
  5     0.753502    -1.992645     0.000084   5
  6     0.904120    -2.012146     0.253874   6
  7     1.054939    -2.051164     0.407455   7
  8     1.204729    -2.107090     0.352265   8
  9     1.356227    -2.145477     0.236853   9
10     1.507559     0.000000     0.000000  10
初末位置的能量我多次验算都是最低的，不知道是什么原因，求大神们不吝指教我这个新手！谢谢啦
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-11-04 12:04:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zjh-111

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 身在长沙 at 2013-11-04 16:49:32
我的计算脚本都是师兄师姐用过留下来的，这让我怎么搞啊？还有这个脚本最新的你知道在哪里下载吗？  麻烦你了...

嗯，我都是自己写，你可以上官网下个最新的看看，要么你那个脚本贴出来给我看看
一般情况我觉得问题不大，很可能就是把负号当正号就行了

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
9楼2013-11-04 18:40:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答

liu-biao

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
求楼下解决  我也遇到了 大神们 求支援
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2013-11-04 12:16:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
identation: 金币+1, 谢谢交流 2013-11-04 13:53:17
你把03这个结构拿出来 做一下结构优化，看看是否能够回到00结构
不能的话，就是你初始结构没找对，也就是说没有找到能量最低结构
赞一下 回复此楼
3楼2013-11-04 12:43:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

身在长沙

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by emilyoyang at 2013-11-04 12:43:21
你把03这个结构拿出来 做一下结构优化，看看是否能够回到00结构
不能的话，就是你初始结构没找对，也就是说没有找到能量最低结构

谢谢你的回复，这个我做过了，弛豫之后又回到00结构了。而且我做到这个构型的能量最低位置与文献上的是一致的。我怀疑是参数设置那里出了问题，麻烦你再帮我看看。新手上路，请多多指教啊！
赞一下 回复此楼
4楼2013-11-04 13:10:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 【长期招聘】复旦大学 AI 制药实验室 博士后招聘 +3 第三种态度 2026-10-28 9/450 2026-11-02 13:06 by Grace_PepLib
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-02 12:25 by n0P4fnsXKbBK
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 BCdvBAEpt3zm 2026-11-01 4/200 2026-11-02 10:23 by dcc2yOIRGGTT
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 YXM1FDCSE8Bn 2026-10-31 6/300 2026-11-02 09:36 by dcc2yOIRGGTT
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 13/650 2026-11-02 06:03 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 10/500 2026-11-02 06:00 by xzcv0Tehd8lQ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 11/550 2026-11-02 06:00 by xzcv0Tehd8lQ
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 16/800 2026-11-02 05:47 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 14/700 2026-11-02 05:41 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 27/1350 2026-11-02 05:28 by xzcv0Tehd8lQ
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 16/800 2026-11-02 02:47 by xzcv0Tehd8lQ
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 16/800 2026-11-02 02:34 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 22:11 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 21:45 by xzcv0Tehd8lQ
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 8/400 2026-11-01 21:35 by xzcv0Tehd8lQ
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 19:50 by xzcv0Tehd8lQ
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 13/650 2026-11-01 16:48 by BCdvBAEpt3zm
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 8/400 2026-11-01 14:48 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 5/250 2026-11-01 12:51 by BCdvBAEpt3zm
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 8/400 2026-11-01 03:59 by YXM1FDCSE8Bn
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭