24小时热门版块排行榜    

查看: 3491  |  回复: 6

yuren2009

木虫 (正式写手)

[求助] 我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些相关参数?

我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些参数?结果如何分析?直接在序列框中输入上空格分开下游引物blast的结果有其他的菌,但是分值低,有些是单条匹配,能说明特异性差么?
回复此楼
学习使你立于不败之地
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

笨熊zhou

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
yuren2009: 金币+5 2013-11-11 17:10:12
利用引物扩增不同的DNA片段试试,
每天对着镜子开心一笑
2楼2013-11-11 15:24:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
yuren2009: 金币+5 2013-11-11 17:14:09
其实用primer-blast也很简单的,大部分参数不用动,选择好物种就可以了

我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些相关参数?
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2013-11-11 16:54:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuren2009

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by gyesang at 2013-11-11 16:54:19
其实用primer-blast也很简单的,大部分参数不用动,选择好物种就可以了

这个是验证与目标物种的DNA匹配情况吧?我想验证对多种序列或大范围内的特异性,还在这里输入?
学习使你立于不败之地
4楼2013-11-11 17:14:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

引用回帖:
4楼: Originally posted by yuren2009 at 2013-11-11 17:14:00
这个是验证与目标物种的DNA匹配情况吧?我想验证对多种序列或大范围内的特异性,还在这里输入?...

你不应该用primer blast,直接基因引物序列进行blast就可以了,不知道你究竟想做什么

我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些相关参数?-1
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2013-11-11 17:24:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuren2009

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by gyesang at 2013-11-11 17:24:37
你不应该用primer blast,直接基因引物序列进行blast就可以了,不知道你究竟想做什么

...

Optimize for Somewhat similar sequences (blastn)后出现的--Algorithm parameters-设置不确定,页面库各个时候不同。
学习使你立于不败之地
6楼2013-11-11 18:51:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Libra-z

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by gyesang at 2013-11-11 17:24:37
你不应该用primer blast,直接基因引物序列进行blast就可以了,不知道你究竟想做什么

...

小虫大神好,有个问题想请教一下,我想设计小鼠特异的一段引物,这个引物只能扩增出小鼠的序列,而不是其他生物的,如:微生物、猫……。请问怎么blast喃?看到您曾经的应助帖感觉您知道,这个问题实在困扰太久,不知小虫大神是否有时间可以回复?
7楼2015-10-23 20:03:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yuren2009 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 5/250 2026-11-07 08:24 by byEJ59EAM6hR
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +10 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 22/1100 2026-11-06 17:18 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 5/250 2026-11-06 16:43 by 5sJFDKp2kwuI
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:23 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 12/600 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 15/750 2026-11-06 13:49 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 11/550 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 14/700 2026-11-06 13:36 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 10/500 2026-11-06 05:32 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:11 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 04:47 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 8/400 2026-11-06 02:24 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:15 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-05 11:10 by PYZmcHr5kSaq
[基金申请] 各位基础老师们,看完中央《从严治党》的决定后,对学术界更加有信心了吧 +5 iaeyuan 2026-11-01 5/250 2026-11-04 14:43 by jinchengzi
信息提示
请填处理意见