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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 我想进行引物的特异性检验，进入primer-blast，怎么设置一些相关参数？
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yuren2009

木虫 (正式写手)

[求助] 我想进行引物的特异性检验，进入primer-blast，怎么设置一些相关参数？

我想进行引物的特异性检验，进入primer-blast，怎么设置一些参数？结果如何分析？直接在序列框中输入上空格分开下游引物blast的结果有其他的菌，但是分值低，有些是单条匹配，能说明特异性差么？
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学习使你立于不败之地
1楼 2013-10-26 22:23:00
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笨熊zhou

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
yuren2009: 金币+5 2013-11-11 17:10:12
利用引物扩增不同的DNA片段试试，
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每天对着镜子开心一笑
2楼2013-11-11 15:24:06
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
yuren2009: 金币+5 2013-11-11 17:14:09
其实用primer-blast也很简单的，大部分参数不用动，选择好物种就可以了

我想进行引物的特异性检验，进入primer-blast，怎么设置一些相关参数？
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2013-11-11 16:54:19
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yuren2009

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by gyesang at 2013-11-11 16:54:19
其实用primer-blast也很简单的，大部分参数不用动，选择好物种就可以了

这个是验证与目标物种的DNA匹配情况吧？我想验证对多种序列或大范围内的特异性，还在这里输入？
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学习使你立于不败之地
4楼2013-11-11 17:14:00
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主
引用回帖:
4楼: Originally posted by yuren2009 at 2013-11-11 17:14:00
这个是验证与目标物种的DNA匹配情况吧？我想验证对多种序列或大范围内的特异性，还在这里输入？...

你不应该用primer blast,直接基因引物序列进行blast就可以了，不知道你究竟想做什么

我想进行引物的特异性检验，进入primer-blast，怎么设置一些相关参数？-1
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2013-11-11 17:24:37
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yuren2009

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by gyesang at 2013-11-11 17:24:37
你不应该用primer blast,直接基因引物序列进行blast就可以了，不知道你究竟想做什么

...

Optimize for Somewhat similar sequences (blastn)后出现的--Algorithm parameters-设置不确定，页面库各个时候不同。
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学习使你立于不败之地
6楼2013-11-11 18:51:24
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Libra-z

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by gyesang at 2013-11-11 17:24:37
你不应该用primer blast,直接基因引物序列进行blast就可以了，不知道你究竟想做什么

...

小虫大神好，有个问题想请教一下，我想设计小鼠特异的一段引物，这个引物只能扩增出小鼠的序列，而不是其他生物的，如：微生物、猫……。请问怎么blast喃？看到您曾经的应助帖感觉您知道，这个问题实在困扰太久，不知小虫大神是否有时间可以回复？
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7楼2015-10-23 20:03:47
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