24小时热门版块排行榜    

查看: 3395  |  回复: 6

yuren2009

木虫 (正式写手)

[求助] 我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些相关参数?

我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些参数?结果如何分析?直接在序列框中输入上空格分开下游引物blast的结果有其他的菌,但是分值低,有些是单条匹配,能说明特异性差么?
回复此楼
学习使你立于不败之地
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

笨熊zhou

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
yuren2009: 金币+5 2013-11-11 17:10:12
利用引物扩增不同的DNA片段试试,
每天对着镜子开心一笑
2楼2013-11-11 15:24:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
yuren2009: 金币+5 2013-11-11 17:14:09
其实用primer-blast也很简单的,大部分参数不用动,选择好物种就可以了

我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些相关参数?
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2013-11-11 16:54:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuren2009

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by gyesang at 2013-11-11 16:54:19
其实用primer-blast也很简单的,大部分参数不用动,选择好物种就可以了

这个是验证与目标物种的DNA匹配情况吧?我想验证对多种序列或大范围内的特异性,还在这里输入?
学习使你立于不败之地
4楼2013-11-11 17:14:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

引用回帖:
4楼: Originally posted by yuren2009 at 2013-11-11 17:14:00
这个是验证与目标物种的DNA匹配情况吧?我想验证对多种序列或大范围内的特异性,还在这里输入?...

你不应该用primer blast,直接基因引物序列进行blast就可以了,不知道你究竟想做什么

我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些相关参数?-1
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
5楼2013-11-11 17:24:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuren2009

木虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by gyesang at 2013-11-11 17:24:37
你不应该用primer blast,直接基因引物序列进行blast就可以了,不知道你究竟想做什么

...

Optimize for Somewhat similar sequences (blastn)后出现的--Algorithm parameters-设置不确定,页面库各个时候不同。
学习使你立于不败之地
6楼2013-11-11 18:51:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Libra-z

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by gyesang at 2013-11-11 17:24:37
你不应该用primer blast,直接基因引物序列进行blast就可以了,不知道你究竟想做什么

...

小虫大神好,有个问题想请教一下,我想设计小鼠特异的一段引物,这个引物只能扩增出小鼠的序列,而不是其他生物的,如:微生物、猫……。请问怎么blast喃?看到您曾经的应助帖感觉您知道,这个问题实在困扰太久,不知小虫大神是否有时间可以回复?
7楼2015-10-23 20:03:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yuren2009 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +12 archvillain 2026-08-15 23/1150 2026-08-15 20:47 by foyo404
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +8 majunge000 2026-08-11 10/500 2026-08-15 18:55 by Equinoxhua
[基金申请] filecode +8 cratir 2026-08-14 12/600 2026-08-15 18:08 by zyfgau
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +12 Tide man 2026-08-10 13/650 2026-08-15 16:34 by 氺木
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +7 Ldrop2023 2026-08-13 7/350 2026-08-15 15:57 by mzhh2000
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
信息提示
请填处理意见