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superrice木虫 (正式写手)
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[求助]
Dalton2011编译问题请教专家
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首先我参考了小木虫的两个帖子 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3806483&fpage=1 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3808279&fpage=1 按照帖子装了最新的gcc4.8.2，以及ATLAS with full palack，以及64位的openmpi，最后还是遇到问题，计算机知识实在有限，特来请教各位专家 错误信息 gfortran: 错误：unrecognized command line option ‘-module’ gfortran: 错误：unrecognized command line option ‘-fast’ gfortran: 错误：unrecognized command line option ‘-Munroll’ make[1]: *** [dalton.o] 错误 1 make[1]: Leaving directory `/home/guga/Dalton2011_release/DALTON/abacus' make: *** [MAIN_OBJ] 错误 2 我的Makefile.config: = linux # # CPPFLAGS = -DVAR_PGF90 -DSYS_LINUX -DVAR_MFDS -D'INSTALL_WRKMEM=524000000' -D'INSTALL_MMWORK=131000000' -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -DVAR_MPI -DIMPLICIT_NONE -DHAVE_NO_LSEEK64 F90 = mpif90 CC = mpicc LOADER = mpif90 RM = rm -f FFLAGS = -mcmodel=medium -fast -Munroll SAFEFFLAGS = -mcmodel=medium -Mframe CFLAGS = -fast -Munroll -Mvect=idiom -c9x -DRESTRICT=restrict INCLUDES = -I../include MODULES = -module ../modules LIBS = -L/home/guga/mathlib/ATLAS/Temp/lib -llapack -llapack -lf77blas -latlas INSTALLDIR = /home/guga/Dalton2011_release/bin PDPACK_EXTRAS = linpack.o eispack.o gp_zlapack.o gp_dlapack.o GP_EXTRAS = AR = ar ARFLAGS = rvs # flags for ftnchek on Dalton /hjaaj CHEKFLAGS = -nopure -nopretty -nocommon -nousage -noarray -notruncation -quiet -noargumants -arguments=number -usage=var-unitialized # -usage=var-unitialized:arg-const-modified:arg-alias # -usage=var-unitialized:var-set-unused:arg-unused:arg-const-modified:arg-alias # default : dalton linuxparallel.x SAFE_FFLAGS_for_ifort = $(FFLAGS) # # Parallel initialization # MPI_INCLUDE_DIR = MPI_LIB_PATH = MPI_LIB = # # # Suffix rules # hjaaj Oct 04: .g is a "cheat" suffix, for debugging. # 'make x.g' will create x.o from x.F or x.c with -g debug flag set. # .SUFFIXES : .F .F90 .c .o .i .g .s .F.o: $(F90) $(INCLUDES) $(MODULES) $(CPPFLAGS) $(FFLAGS) -c $*.F .F.i: $(F90) $(INCLUDES) $(MODULES) $(CPPFLAGS) -E $*.F > $*.i .F.g: $(F90) $(INCLUDES) $(MODULES) $(CPPFLAGS) $(SAFEFFLAGS) -g -c $*.F .F.s: $(F90) $(INCLUDES) $(MODULES) $(CPPFLAGS) $(FFLAGS) -S -g -c $*.F .F90.o: $(F90) $(INCLUDES) $(MODULES) $(CPPFLAGS) $(FFLAGS) -c $*.F90 .F90.i: $(F90) $(INCLUDES) $(MODULES) $(CPPFLAGS) -E $*.F90 > $*.i .F90.g: $(F90) $(INCLUDES) $(MODULES) $(CPPFLAGS) $(SAFEFFLAGS) -g -c $*.F90 .F90.s: $(F90) $(INCLUDES) $(MODULES) $(CPPFLAGS) $(FFLAGS) -S -g -c $*.F90 .c.o: $(CC) $(INCLUDES) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) -c $*.c .c.i: $(CC) $(INCLUDES) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) -E $*.c > $*.i .c.g: $(CC) $(INCLUDES) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) -g -c $*.c .c.s: $(CC) $(INCLUDES) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) -S -g -c $*.c 小弟在此谢过了 |
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你的openmpi可能是pgfortran（PGI编译器）编译的，你先检查下自己的编译环境吧；自己根目录下的.bashrc以及/etc/profile等里面关于PGI的先去掉吧 用gfortran/gcc编译64 bit openmpi ./configure --prefix=/path/to/your_openmpi CXX=g++ CC=gcc F77=gfortran FC=gfortran FFLAGS="-m64 -fdefault-integer-8" FCFLAGS="-m64 -fdefault-integer-8" CFLAGS=-m64 CXXFLAGS=-m64 |
7楼2013-10-24 21:42:05
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非常感谢专家回复，去掉之后还是有点错误。 use mpi 1 致命错误： Cannot read module file 'mpi.mod' opened at (1), because it was created by a different version of GNU Fortran make[2]: *** [dalton_mpi.o] 错误 1 make[1]: *** [mod] 错误 2 make[1]: Leaving directory `/home/guga/Dalton2011_release/DALTON/lucita' make: *** [LUCITA_OBJ] 错误 2 请问这是怎么回事，是我openmpi没装好吗？我是用新装的GCC编译的呀，好奇怪啊。 |
3楼2013-10-24 20:09:15
wuy069
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你确定你按照我的帖子http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3808279&fpage=1来编译的，看你的FFLAGS参数应该用的不是gfortran和gcc编译的，反而是pgi编译器的pgfortran编译的。 如果是使用的gfortran/gcc，openmpi编译的，你可以直接使用我那帖子中的Makefile.config gnu编译器也能编译成功，但为了程序的执行速度，使用Intel编译器和mkl数学库编译为佳 |
4楼2013-10-24 20:27:09
