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二次PCR
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lb3522922
铜虫
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虫号: 1160474
注册: 2010-12-02
专业: 环境微生物学
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二次PCR
最近再做PCR,第一次的产物不特异,切胶回收后浓度有30ng/μL左右,然后以此为模板进行第二次PCR,具体做法是取1微升模板,引物与前次PCR相同,但是产物跑电泳却没有条带,只有引物二聚体附近的小条带。增加模板的量也不行,不知道问题出在什么地方了。请各位给分析分析。不胜感激。
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1楼
2013-10-22 14:14:05
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liyongliangx
铜虫
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性别: GG
专业: 口腔颌面组织生物力学和生
【答案】应助回帖
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gyesang: 金币+2, 鼓励交流!
2013-10-29 23:54:26
楼主,这个问题曾经困扰我了很久。
我的经验是二次PCR 效果都不是太好,如果需要改进的话我有两个办法:
1.就是设计巢式PCR引物,这样效果会好点;
2.就是把你的片段连到载体里,克隆扩增,酶切也可以;或者用质粒为模板也可以。
建议你不要在这方面浪费太多的时间,尽快跳过这一步,重新设计引物 ,或者连载体都不会花很多时间的
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8楼
2013-10-29 21:48:58
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cicisnow
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注册: 2012-02-20
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专业: 环境微生物学
【答案】应助回帖
★
gyesang: 金币+1, 鼓励交流
2013-10-29 01:38:23
你用什么酶扩增的,有些酶对模板要求很高的
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2楼
2013-10-28 21:00:23
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素手就琴
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注册: 2011-10-21
性别:
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专业: 基因表达调控与表观遗传学
【答案】应助回帖
你说你第一次的产物不特异,那要带marker ,确定你切胶回收的是你需要的那个条带,别切错了。你增加模板,引物二聚体有没有很亮?
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人生多烦忧,不如一吊解千愁~
4楼
2013-10-29 11:59:24
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wuyao0513
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专业: 抗体工程学
【答案】应助回帖
应该是切胶回收后的缓冲液对Taq酶有影响!!
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5楼
2013-10-29 12:00:14
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