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836449366

金虫 (小有名气)

[求助] 高斯计算错误出现内存空间不足,试验多种方法无效

大家好,我的问题是:
高斯出现错误,提示
Out-of-memory error in routine ShPair-LoodLd2 (IEnd=      89705860 MxCore=      81470438)
Use %mem=308MW to provide the minimum amount of memory required to complete this step.
Error termination via Lnk1e in /software/gaussian/g09/l401.exe at Sat Oct 19 21:21:44 2013.
经过网上搜索,已经试了两种方法
第一种修改%mem=800MW/1200MW/1800MW,均试过无效
第二种在.bashrc中加export GAUSS_MEMDEF=800MW,无效
还有,为了防止多个任务抢占内存,我用一个计算节点算一个任务,还是失败
本人已经无力了,求虫友帮忙,在此表示感谢!
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abdoman

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gkf高: 金币+2 2013-10-22 20:23:31
我建议你试试这样。
1. 把cpu调低,比如16个。
2. 然后内存提高。
%mem=30Gb
高斯
如果报错,说allocated memory is not enough (也许不是原话,但是意思差不多就行)
那就降低内存。

PS: 你的截图是就是你要用的计算节点吗? 感觉不是空载的。也许只是为了截图需要吧。
Youcompleteme.
9楼2013-10-22 08:12:36
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+1 2013-10-21 09:59:23
不加%mem,用默认内存跑是否可行?
2楼2013-10-21 08:10:41
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836449366

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-10-21 08:10:41
不加%mem,用默认内存跑是否可行?

就是因为默认内存不行,我才更换的,提示错误也和上面的说法差不多
3楼2013-10-21 08:38:26
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abdoman

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
按照%mem 进行修改就可以了
问题是: 1,你机器物理内存有多少?是win 还是linux?
2,如果说仅仅跑这一个程序,那程序可以用的内存估计有多少?尽量调到上限值试试。
Youcompleteme.
4楼2013-10-21 10:17:20
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