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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】高斯内存出错，无法计算了....
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fish_tank

金虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】高斯内存出错，无法计算了.... 已有4人参与

做高斯计算输入文件如下：
%nprocshared=4
%mem=2GB
%chk=01-1.chk
# opt freq b3lyp/6-311g(d) geom=connectivity
但是提交之后，出现：
galloc:  could not allocate memory.: Cannot allocate memory
目前机器没有作业运行，之前也用同样的输入是可以算得，求助一下各位有没有遇到这种情况，难道是内存满了，还是怎么了？
之前由于其他作业调用内存过高也出现过这个情况，内存较高的作业跑完，接下来就可以算其他作业了。现在就连单核的计算也会自己跳出，不知道是怎么了！请问怎样可以解决。
机器的内存情况是：
Mem:  12290936k total, 11295388k used,   995548k free,   107464k buffers
Swap:  4192956k total,  4192536k used,      420k free,   312996k cached
是不是内存的问题呢？如何解决！谢谢各位了！
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1楼 2010-08-18 17:19:04
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT
★
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数数总会吧。12G内存用了11G，还剩不到1G，你申请2G当然出错啊。
等吧。等内存空出来就行啦。
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
2楼2010-08-18 20:52:00
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
★
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主要的问题是 Swap:  4192956k total,  4192536k used,  


^_^
这个系统的效率 堪忧阿
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Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
3楼2010-08-18 21:43:44
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fish_tank

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2010-08-18 20:52:00:
数数总会吧。12G内存用了11G，还剩不到1G，你申请2G当然出错啊。
等吧。等内存空出来就行啦。

恩，谢谢了！我才接触高斯有些地方不是很明白！那么，这个内存用清理吗？还是过一段机器自己就清理了？（小白）
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4楼2010-08-18 22:40:17
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fish_tank

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by abbott at 2010-08-18 21:43:44:
主要的问题是 Swap:  4192956k total,  4192536k used,  


^_^
这个系统的效率 堪忧阿

恩，那请问有什么办法可以解决吗？谢谢了！
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5楼2010-08-18 22:41:27
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fish_tank

金虫 (初入文坛)

问题解决，谢谢各位

昨天发帖求助，高斯内存占用过高的问题已经解决，我把系统重启了，服务重新开启就ok了，真是崩溃了，现在可以跑高斯了....
现在内存情况是：
Mem:  12290936k total,  1084548k used, 11206388k free,    39352k buffers
Swap:  4192956k total,        0k used,  4192956k free,   516132k cached
长叹一口气...
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6楼2010-08-19 16:48:49
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
★
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引用回帖:
Originally posted by abbott at 2010-08-18 21:43:44:
主要的问题是 Swap:  4192956k total,  4192536k used,  
^_^
这个系统的效率 堪忧阿

linux系统自己不清理内存吗？恐怖……
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7楼2010-08-20 15:28:54
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