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lihui_2004

金虫 (小有名气)

[求助] MADLI TOF TOF 鉴定

大家做双向电泳后期进行蛋白点的鉴定时,用MADLI TOF TOF鉴定一般成功率是多少?我的是植物,鉴定成功率不到40%(置信区间大于95%的),觉得太低了,还有大家送样的时候(考染)送的是肉眼明显识别的还是扫描图上可以看见的但肉眼不是很明显的就送了?
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Dream what you want to dream, go where you want to go, be what you want to be.
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DBWJ

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 金币+1, 谢谢参与 2013-10-16 05:54:43
lihui_2004: 金币+2 2013-10-23 16:46:45
你这个鉴定不成功指的是搜库结果都没有吗?还是没有你的蛋白?
一般考染的话能看见的都能做出来的
2楼2013-10-15 16:42:00
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
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lihui_2004: 金币+2 2013-10-23 16:46:39
如果指的是通过质谱鉴定蛋白的成功率的话,不完全取决于你的实验,质谱的成功率,是不是模式生物(可能没有相应的蛋白库)等都有影响
3楼2013-10-16 05:56:58
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lihui_2004

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by DBWJ at 2013-10-15 16:42:00
你这个鉴定不成功指的是搜库结果都没有吗?还是没有你的蛋白?
一般考染的话能看见的都能做出来的

是搜库没有,不过公司解释说我的样品量低,但是有些很明显的点也没有鉴定出来。
Dream what you want to dream, go where you want to go, be what you want to be.
4楼2013-10-23 16:45:43
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lihui_2004

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wizardfan at 2013-10-16 05:56:58
如果指的是通过质谱鉴定蛋白的成功率的话,不完全取决于你的实验,质谱的成功率,是不是模式生物(可能没有相应的蛋白库)等都有影响

嗯,是的呢,后期在补些样,想排除是我的样品量的问题。
Dream what you want to dream, go where you want to go, be what you want to be.
5楼2013-10-23 16:46:31
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DBWJ

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by lihui_2004 at 2013-10-23 16:45:43
是搜库没有,不过公司解释说我的样品量低,但是有些很明显的点也没有鉴定出来。...

数据库不全会出现鉴定不到的情况,你可以弄一个参考序列让公司帮你对比
6楼2013-10-24 09:52:54
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