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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】算反应过渡态时，gaussian频率分析
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tjbj

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】算反应过渡态时，gaussian频率分析

求算反应过渡态时，gaussian频率分析出现两个或多个负值
                   A'                     A"                     A'
Frequencies -- -1722.2074              -850.7679               418.0523
此时应如何调整输入文件？

[ Last edited by zzgyb on 2008-1-10 at 12:04 ]
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1楼 2007-12-04 00:50:46
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suntao1982

木虫 (著名写手)

小木虫
★
csfn(金币+1,VIP+0):3q,感谢积极参与交流
找到出现虚频的原子，记得好像有一个差值，把它加到原坐标上。不知道行不行，单个分子出现虚频的时候我是这样解决的。
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做中国人的化学！！！！
2楼2007-12-04 08:42:51
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tjbj

银虫 (小有名气)

怎么操作

我在算SiH4 -->SiH2+H2 反应过渡态时，总是出现两个虚频，输入文件如下，请问应如何调整？
%chk=qst2
#hf/3-21g* opt=(QST2,noeigen,redundant) freq Test

SiH4 -->SiH2+H2   Reactants

0  1
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 R 5 A2 2 180.0

R=1.48
A1=125.2
A2=109.5

SiH4-->SiH2+H2  products

2  3
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 R 5 A2 2 180.0

R=1.69
A1=82.0
A2=28.0
我调整时如果正常终止，总是两个虚频，值也变化不大。或是无法正常终止，显示
Determination of dummy atom variables in z-matrix conversion failed.
NNew=      2.75971287D+00 NOld=      2.79051346D+00 Diff= 3.08D-02
请问这种情况应怎么办？
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3楼2007-12-04 08:49:10
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wonderflyer

木虫 (正式写手)
★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的帮助！欢迎你继续来计算模拟版解答问题
固定你想要的虚频振动的原子坐标，然后再优化之至收敛，看另一不想要的虚频能不能去掉。另外，你为什么要用QST2方法找TS，而不直接使用OPT=TS方法找你想要的TS？你的做法会很浪费时间。个人看法。
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4楼2007-12-04 11:24:20
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wanghongbo0808

银虫 (小有名气)
★
小红豆(金币+1,VIP+0):辛苦了！
QST2比较准确不会找错（把扩散时的物质当作TS） OPT没用过不知道
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i don't care who you are where you're from what you did as long as you love MS群：50691921
5楼2007-12-04 17:47:28
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brover

捐助贵宾 (正式写手)

学术刺客
★
spur(金币+1,VIP+0):感谢参与！欢迎常来！：）
可能是对称性太高了吧
试试第三和第四个H的键长不要设一样的值，稍微±0.0001，或者0.001
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6楼2008-01-07 12:38:46
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knight1014

至尊木虫 (著名写手)
一方面在于你的方法和机组比较低，这样的情况我们也常遇到，如果用B3LYP/6-311G**,有可能把较小的一个去掉，另外你可以按照它们的震动方向把不要的那个调整一下用OPT=TS 的方法直接优化可能会得到好的结果，试一试看
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7楼2008-01-10 21:59:10
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