24小时热门版块排行榜    

查看: 1231  |  回复: 6
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

tjbj

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】算反应过渡态时,gaussian频率分析

求算反应过渡态时,gaussian频率分析出现两个或多个负值
                   A'                     A"                     A'
Frequencies -- -1722.2074              -850.7679               418.0523
此时应如何调整输入文件?

[ Last edited by zzgyb on 2008-1-10 at 12:04 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brover

捐助贵宾 (正式写手)

学术刺客


spur(金币+1,VIP+0):感谢参与!欢迎常来!:)
可能是对称性太高了吧
试试第三和第四个H的键长不要设一样的值,稍微±0.0001,或者0.001
6楼2008-01-07 12:38:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

suntao1982

木虫 (著名写手)

小木虫


csfn(金币+1,VIP+0):3q,感谢积极参与交流
找到出现虚频的原子,记得好像有一个差值,把它加到原坐标上。不知道行不行,单个分子出现虚频的时候我是这样解决的。
做中国人的化学!!!!
2楼2007-12-04 08:42:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjbj

银虫 (小有名气)

怎么操作

我在算SiH4 -->SiH2+H2 反应过渡态时,总是出现两个虚频,输入文件如下,请问应如何调整?
%chk=qst2
#hf/3-21g* opt=(QST2,noeigen,redundant) freq Test

SiH4 -->SiH2+H2   Reactants

0  1
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 R 5 A2 2 180.0

R=1.48
A1=125.2
A2=109.5

SiH4-->SiH2+H2  products

2  3
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 R 5 A2 2 180.0

R=1.69
A1=82.0
A2=28.0
我调整时如果正常终止,总是两个虚频,值也变化不大。或是无法正常终止,显示
Determination of dummy atom variables in z-matrix conversion failed.
NNew=      2.75971287D+00 NOld=      2.79051346D+00 Diff= 3.08D-02
请问这种情况应怎么办?
3楼2007-12-04 08:49:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wonderflyer

木虫 (正式写手)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的帮助!欢迎你继续来计算模拟版解答问题
固定你想要的虚频振动的原子坐标,然后再优化之至收敛,看另一不想要的虚频能不能去掉。另外,你为什么要用QST2方法找TS,而不直接使用OPT=TS方法找你想要的TS?你的做法会很浪费时间。个人看法。
4楼2007-12-04 11:24:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +4 西山十月 2026-08-09 6/300 2026-08-10 00:16 by liufeng0619
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +15 且听虎啸 2026-08-07 22/1100 2026-08-09 22:13 by 布布和一二
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +10 布布和一二 2026-08-08 21/1050 2026-08-09 17:21 by 天神眷顾
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 5/250 2026-08-08 21:54 by 13586093586
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 好奇怪的filecode +3 布布和一二 2026-08-08 4/200 2026-08-08 17:46 by zhanghaozhu
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 什么时候能放榜呀? +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
请填处理意见