24小时热门版块排行榜    

查看: 1218  |  回复: 6
当前主题已经存档。

tjbj

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】算反应过渡态时,gaussian频率分析

求算反应过渡态时,gaussian频率分析出现两个或多个负值
                   A'                     A"                     A'
Frequencies -- -1722.2074              -850.7679               418.0523
此时应如何调整输入文件?

[ Last edited by zzgyb on 2008-1-10 at 12:04 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

suntao1982

木虫 (著名写手)

小木虫


csfn(金币+1,VIP+0):3q,感谢积极参与交流
找到出现虚频的原子,记得好像有一个差值,把它加到原坐标上。不知道行不行,单个分子出现虚频的时候我是这样解决的。
做中国人的化学!!!!
2楼2007-12-04 08:42:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjbj

银虫 (小有名气)

怎么操作

我在算SiH4 -->SiH2+H2 反应过渡态时,总是出现两个虚频,输入文件如下,请问应如何调整?
%chk=qst2
#hf/3-21g* opt=(QST2,noeigen,redundant) freq Test

SiH4 -->SiH2+H2   Reactants

0  1
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 R 5 A2 2 180.0

R=1.48
A1=125.2
A2=109.5

SiH4-->SiH2+H2  products

2  3
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 R 5 A2 2 180.0

R=1.69
A1=82.0
A2=28.0
我调整时如果正常终止,总是两个虚频,值也变化不大。或是无法正常终止,显示
Determination of dummy atom variables in z-matrix conversion failed.
NNew=      2.75971287D+00 NOld=      2.79051346D+00 Diff= 3.08D-02
请问这种情况应怎么办?
3楼2007-12-04 08:49:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wonderflyer

木虫 (正式写手)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的帮助!欢迎你继续来计算模拟版解答问题
固定你想要的虚频振动的原子坐标,然后再优化之至收敛,看另一不想要的虚频能不能去掉。另外,你为什么要用QST2方法找TS,而不直接使用OPT=TS方法找你想要的TS?你的做法会很浪费时间。个人看法。
4楼2007-12-04 11:24:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanghongbo0808

银虫 (小有名气)


小红豆(金币+1,VIP+0):辛苦了!
QST2比较准确不会找错(把扩散时的物质当作TS) OPT没用过不知道
i don't care who you are where you're from what you did as long as you love MS群:50691921
5楼2007-12-04 17:47:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brover

捐助贵宾 (正式写手)

学术刺客


spur(金币+1,VIP+0):感谢参与!欢迎常来!:)
可能是对称性太高了吧
试试第三和第四个H的键长不要设一样的值,稍微±0.0001,或者0.001
6楼2008-01-07 12:38:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

knight1014

至尊木虫 (著名写手)

一方面在于你的方法和机组比较低,这样的情况我们也常遇到,如果用B3LYP/6-311G**,有可能把较小的一个去掉,另外你可以按照它们的震动方向把不要的那个调整一下用OPT=TS 的方法直接优化可能会得到好的结果,试一试看
7楼2008-01-10 21:59:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 tjbj 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +3 布布和一二 2026-08-08 3/150 2026-08-08 18:15 by Lightingo
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 好奇怪的filecode +3 布布和一二 2026-08-08 4/200 2026-08-08 17:46 by zhanghaozhu
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:22 by oEVWOejN9taj
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:19 by oEVWOejN9taj
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:22 by oEVWOejN9taj
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:02 by oEVWOejN9taj
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:39 by oEVWOejN9taj
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 4/200 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +3 布布和一二 2026-08-07 3/150 2026-08-07 15:09 by gltch
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 什么时候能放榜呀? +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
请填处理意见