24小时热门版块排行榜    

查看: 898  |  回复: 6
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

tjbj

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】算反应过渡态时,gaussian频率分析

求算反应过渡态时,gaussian频率分析出现两个或多个负值
                   A'                     A"                     A'
Frequencies -- -1722.2074              -850.7679               418.0523
此时应如何调整输入文件?

[ Last edited by zzgyb on 2008-1-10 at 12:04 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanghongbo0808

银虫 (小有名气)


小红豆(金币+1,VIP+0):辛苦了!
QST2比较准确不会找错(把扩散时的物质当作TS) OPT没用过不知道
i don't care who you are where you're from what you did as long as you love MS群:50691921
5楼2007-12-04 17:47:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

suntao1982

木虫 (著名写手)

小木虫


csfn(金币+1,VIP+0):3q,感谢积极参与交流
找到出现虚频的原子,记得好像有一个差值,把它加到原坐标上。不知道行不行,单个分子出现虚频的时候我是这样解决的。
做中国人的化学!!!!
2楼2007-12-04 08:42:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjbj

银虫 (小有名气)

怎么操作

我在算SiH4 -->SiH2+H2 反应过渡态时,总是出现两个虚频,输入文件如下,请问应如何调整?
%chk=qst2
#hf/3-21g* opt=(QST2,noeigen,redundant) freq Test

SiH4 -->SiH2+H2   Reactants

0  1
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 R 5 A2 2 180.0

R=1.48
A1=125.2
A2=109.5

SiH4-->SiH2+H2  products

2  3
Si
X 1 1.0
H 1 1.48 2 55.0
H 1 1.48 2 55.0 3 180.0
H 1 R 2 A1 3 90.0
H 1 R 5 A2 2 180.0

R=1.69
A1=82.0
A2=28.0
我调整时如果正常终止,总是两个虚频,值也变化不大。或是无法正常终止,显示
Determination of dummy atom variables in z-matrix conversion failed.
NNew=      2.75971287D+00 NOld=      2.79051346D+00 Diff= 3.08D-02
请问这种情况应怎么办?
3楼2007-12-04 08:49:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wonderflyer

木虫 (正式写手)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的帮助!欢迎你继续来计算模拟版解答问题
固定你想要的虚频振动的原子坐标,然后再优化之至收敛,看另一不想要的虚频能不能去掉。另外,你为什么要用QST2方法找TS,而不直接使用OPT=TS方法找你想要的TS?你的做法会很浪费时间。个人看法。
4楼2007-12-04 11:24:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见