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引物设计
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找公司设计了引物，各设计了两个，对这块一点不懂，谁能帮看下特异性什么的，看能不能用？ Generic primers: PPAR γ Orientation Start Len Tm GC% Any lFORWARD 642 21 58.79 42.86 3.00 REVERSE 732 22 59.38 45.45 2.00 Primer Seq TGCCAAGCATTTGTATGACTC TTTGTCTGTCGTCTTTCCTGTC Orientation Start Len Tm GC% Any FORWARD 242 20 58.38 55.00 3.00 REVERSE 345 19 59.98 52.63 2.00 Primer Seq AGCCTCCTTCTCCTCCCTAT CCCACACACACGACATTCA Generic primers: SOD Orientation Start Len Tm GC% Any FORWARD 271 20 60.25 55.00 3.00 REVERSE 427 21 59.18 47.62 3.00 Primer Seq AAGGGAGGAGTGGCAGAAGT GAGGTCCAGCATTTCCAGTTA Orientation Start Len Tm GC% Any FORWARD 54 19 59.20 57.89 2.00 REVERSE 171 20 59.39 45.00 3.00 Primer Seq GGTCATCCACTTCCAGCAG CCCATTTGTGTTGTCTCCAA |
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2楼2013-10-12 15:27:00
3楼2013-10-12 15:29:27
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4楼2013-10-12 15:39:06
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引物要公司合成，下面的就我自己做了，他给分别设计了两个，哪个更好些？ PPAR γ的原始序列 ORIGIN 1 attacaatgg ttgacacaga aatgccgttt tggcccgtta attttggaat tagcccagtg 61 gatctgtctg cgatggatga tcatatgcat tcctttgaca taaagccatt taccactgtt 121 gatttttcaa gcatttcttc accacactat gaagatatac ctcttggaag agctgatcaa 181 acaagcattg attataaata tgatatcaag ctccaggatt gccaaagtgc aatcaaaatg 241 gagcctcctt ctcctcccta tttttctgaa aaagtgcagt tatacaataa acctcacgag 301 gagtcttcca actcacttat ggctattgaa tgtcgtgtgt gtggggacaa ggcctctgga 361 tttcattatg gagtgcatgc atgtgaaggt tgtaagggct tttttcgaag aacaatcaga 421 ttaaagctta tttatgatag gtgtgacctt aattgtcgca tccataagaa aagcagaaat 481 aagtgtcaat actgcagatt tcagaaatgt cttgcagttg gaatgtcaca taatgccatc 541 aggtttgggc gaatgccaca agcggagaag gagaagctct tggcagagat ttccagcgac 601 atcgaccagt taaatcctga atctgctgat ctgcgagcgc ttgccaagca tttgtatgac 661 tcatacataa agtccttccc gctgaccaaa gccaaggcaa gggcgatctt gacaggaaag 721 acgacagaca aatcaccatt tgttatttat gacatgaact ctttaaggat gggagaagat 781 cagatcaagt gtaagcatgc atcaccactg caggaacaga acaaagaagt agcaattcgc 841 attttccagc gatgtcagtt tcgctctgtg gaggcagtgc aggagattac agaatttgcg 901 aagaacattc caggttttgt gaatcttgac ctgaatgatc aggtaaccct cctgaaatat 961 ggtgtccatg agatcatata tactctcctg gcttctctca tgaataaaga tggagttctt 1021 atatctgatg gacaaggatt catgacacgg gagtttctga agagtctgag aaaacctttt 1081 tgtgacttta tggagcccaa gtttgagttt gctgtgaagt tcaacgcact ggaattagat 1141 gacagtgacc tggcaatatt tatagctgtc attatactaa gtggagatcg cccaggtttg 1201 ttaaatgtga agcccattga agatatacaa gataatctgt tgcaagcttt ggagctccag 1261 ctaaagctga atcatccaga gtcatcacag ctgtttgcaa aattgcttca gaaaatgacg 1321 gacctcagac aaattgtaac ggaacacgtg cagctgttgc aaataataaa gaaaacggaa 1381 acagatatga gtcttcatcc actcctacaa gaaatctata aagacttata ttaatggcga 1441 tagtagttct tatcctctga cataatgtat gttcttcaga ttgcactatt tctttgagag 1501 aaaactttgc atacttaaga aattactgtg aaacagcatt taaagaagag agagcttagt 1561 atagtagatc tattttatgc atattgttta taaagacaca tttacaattt acttttaata 1621 ttaataatat ctatatcatg aaattgttgg cagtattttc agaattaatt tttttaacta 1681 tcttatttcc taaaattgct tgtccagtat gattgatgct tgcttcactg aggttggtta 1741 agcatgcagt taaattttca acttaaaaat aaaaatcttt ctccttaaac atttctaggg 1801 aaacatttta agtattatgt ttgattctgt gctcccaagg cagcggcaaa ataacaatga 1861 agttgaatca ttgattagca caacttcaca caaggactca aaagggaaaa gttagacatg 1921 tcaggtctag tagttgttcc taccataatc aattttcaaa ctgatagagt tctgtaacga 1981 ggacttttca tacgtatgaa ttaggccatc atttatgggc actcaaaaaa ttgactccat 2041 ttcaagcatt aattgaggaa tatacactgc tcatcacttt cttagagat SOD的原始序列 ORIGIN 1 atggcgacgc tgaaggccgt gtgcgtgatg aagggggacg cccccgtgga gggggtcatc 61 cacttccagc agcaggggag cgggccagta aaggttactg gaaaaattac cggcttgtct 121 gatggagatc atggcttcca tgtgcatgaa tttggagaca acacaaatgg gtgtaccagc 181 gcaggtgctc actttaatcc tgaaggcaag cagcacggtg gaccaaaaga tgcagatagg 241 cacgtgggtg acctcggcaa tgtgactgca aagggaggag tggcagaagt agaaatagaa 301 gattctgtca tttctcttac cggaccacac tgcatcattg gccgtaccat ggtggtccat 361 gcaaaaagtg atgacctggg tagaggggga gataatgaga gcaaactaac tggaaatgct 421 ggacctcgtt tagcttgtgg tgtaattgga atagccaagt gctaaccgtt gtacctgaaa 481 tgcttaagat ggcagtggga aatgagctgt atttcattgt gattgctgta cttgctcttc 541 cgtgtgcaag caaaagattt atcacttaat ctcattacta ctctgctgtc ttgagtatca 601 gtttaactgg tgaatactga cataatttcg tattatgtat attgcaatta aagtgttact 661 aatgga |
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