应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 在charmm27立场文件里面，找不到需要的力场参数 怎么办？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
61/1返回列表
查看: 2039  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

小仆人

新虫 (初入文坛)

[求助] 在charmm27立场文件里面，找不到需要的力场参数 怎么办？

最近在模拟 UREA  在charmm27的力场里面，但是找不到 N-C-N 的参数， 怎么办？？着急啊！！
回复此楼

» 猜你喜欢
Jesus shall take the highest honor
1楼 2013-10-08 12:00:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小仆人

新虫 (初入文坛)
太感谢了！！
回复此楼
Jesus shall take the highest honor
2楼2013-10-08 12:12:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小仆人: 金币+5, ★★★很有帮助, 太感谢了，虽然还不知道怎么安装36， 谢谢！很有用！ 2013-10-08 23:28:01
月只蓝: 金币+1, 感谢指导！ 2013-12-18 08:47:57
把你的分子提交到这里试试https://www.paramchem.org/

另外，现在有CHARMM36了，为什么要用CHARMM27呢？
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2013-10-08 14:28:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fhh2626

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-12-18 08:48:07
http://mackerell.umaryland.edu/CHARMM_ff_params.html
最新的CHARMM力场在这里下
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2013-10-09 14:50:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

s6120610021

铜虫 (小有名气)
您好，我最近刚开始看gromacs，感觉很糊涂，不知如何下手，在小木虫上看到您对这个方向比较了解，想请教一下。
1、我看的网上教程，做模拟不是要先获得pdb,然后获得top文件，我的模型和溶剂找不到，要不要自己画？怎么弄？
2、我模拟一种分子在溶剂中的STCFs（停留时间函数） 和 MSDs（均方位移）我应该从手册哪方面看起。
最后谢谢您的指导！
赞一下 回复此楼
5楼2013-12-17 21:52:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小仆人

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by s6120610021 at 2013-12-17 21:52:38
您好，我最近刚开始看gromacs，感觉很糊涂，不知如何下手，在小木虫上看到您对这个方向比较了解，想请教一下。
1、我看的网上教程，做模拟不是要先获得pdb,然后获得top文件，我的模型和溶剂找不到，要不要自己画？ ...

您好：
溶剂的gro文件一般是用其他的文件生成的，或者是别人提供的。。。。

top文件一般需要动手做，我也是刚刚入行，多交流：）
赞一下 回复此楼
Jesus shall take the highest honor
6楼2014-01-07 14:38:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小仆人 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 电子信息调剂交叉学科有推荐吗 +5 jhtfeybgj 2026-04-01 7/350 2026-04-04 07:13 by 孙嘉欣2025
[考研] 303求调剂 +9 DLkz1314. 2026-03-30 9/450 2026-04-03 18:34 by ls刘帅
[考研] 334求调剂 +9 Trying] 2026-03-31 9/450 2026-04-03 15:18 by 琢珥丶
[考研] 085600专硕材料与化工348分求调剂 +10 上学啦！ 2026-04-01 11/550 2026-04-03 14:13 by 百灵童888
[考研] 数一英一285求调剂 +7 AZMK 2026-04-03 9/450 2026-04-03 13:03 by ms629
[考研] 279求调剂 +6 qazplm0852 2026-04-02 6/300 2026-04-03 10:03 by 蓝云思雨
[考研] 325分化学调剂 +5 15771691647 2026-04-02 5/250 2026-04-03 09:58 by ChemPharm
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-04-02 3/150 2026-04-03 08:44 by yulian1987
[考研] 求调剂求调剂 +7 121. 2026-04-02 7/350 2026-04-02 19:15 by dick_runner
[考研] 298求B区调剂 +4 zzz，，r 2026-04-02 5/250 2026-04-02 12:17 by 土木硕士招生
[考研] 324求调剂 +5 想上学求调 2026-04-01 6/300 2026-04-02 10:16 by sanrepian
[考研] 求调剂，一志愿南京师范大学计算机专硕，初试373，六级通过， +3 计算机追梦人 2026-04-01 3/150 2026-04-02 07:57 by fxue1114
[考研] 11408 321分求调剂 +3 huchun12138 2026-03-30 4/200 2026-04-01 22:48 by guanxin1001
[考研] 286求调剂 +5 Sa67890. 2026-04-01 7/350 2026-04-01 19:50 by 6781022
[考研] 材料专硕306英一数二 +7 z1z2z3879 2026-03-31 7/350 2026-04-01 14:50 by ZXlzxl0425
[考研] 262求调剂 +9 励志一定发文章 2026-03-31 10/500 2026-04-01 12:22 by sunshine0013
[考研] 0856调剂 +7 曲听筠 2026-03-30 7/350 2026-04-01 08:51 by JourneyLucky
[考研] 江苏苏北高校诚邀调剂同学 +3 zzll406 2026-03-31 3/150 2026-03-31 16:54 by 及时行乐fan
[基金申请] 面上5B能上会吗？ +8 redcom 2026-03-29 8/400 2026-03-31 15:53 by niuailing
[考研] 269求调剂 +4 我想读研11 2026-03-31 4/200 2026-03-31 10:04 by cal0306
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭