| 查看: 2514 | 回复: 15 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
therotyonth金虫 (正式写手)
|
[求助]
Gaussian 09 处理后的文件始终无法在AMBER中的antechamber命令中完成
|
|
|
输入文件flu.com --Link1-- %chk=molecule #HF/6-31G* SCF=tight Test Pop=MK iop(6/33=2) iop(6/42=6) opt iop(6/50=1) remark line goes here 0 1 …………………… PBS文件 #!/bin/bash # #PBS -l nodes=1:ppn=12 #PBS -l walltime=1444:00:00 #PBS -V cd $PBS_O_WORKDIR export g09root=/share/apps/software source $g09root/g09/bsd/g09.profile export GAUSS_SCRDIR=/state/partition1 date g09 /home/flu.com date 处理后的文件flu.log用以下命令 antechamber -i flu.log -fi gout -o flu.prepi -fo prepi -c resp -s 2 提示： Running: /usr/local/amber12/bin/bondtype -j full -i ANTECHAMBER_BOND_TYPE.AC0 -o ANTECHAMBER_BOND_TYPE.AC -f ac Running: /usr/local/amber12/bin/atomtype -i ANTECHAMBER_AC.AC0 -o ANTECHAMBER_AC.AC -p gaff Running: /usr/local/amber12/bin/espgen -o ANTECHAMBER.ESP -i flu.log espgen cannot deal with Gaussian 09 log file, please generate Gaussian 09 ESP file using iop(6/50=1) and rerun espgen Error: cannot run "/usr/local/amber12/bin/espgen -o ANTECHAMBER.ESP -i flu.log" in resp() of charge.c properly, exit 这个是怎么回事呀？ 刚刚接触计算，望各位大侠能帮帮茫茫哈！ |
回复此楼» 猜你喜欢
今年面上没有消息，想来是没了，散个金攒攒人品，为明年祈福
已经有698人回复
-
合肥工业大学854仪器技术综合专业课考研
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有213人回复
-
27年电化学博士毕业，想找海外QS前50的高校读博后求推荐
已经有3人回复
-
27年电池/材料类博士申请
已经有2人回复
-
澳大利亚南昆士兰大学量子点课题组招收博士生
已经有0人回复
-
2027年博士申请或转博科研助理 求推荐
已经有1人回复
-
氯化钠与有机磺酸分离
已经有0人回复
-
瑞典-博后-固态电池-粘结剂-锂离子电池方向
已经有16人回复
-
香港中文大学（深圳）2026年招聘公告
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
7楼2013-10-07 11:16:16
therotyonth
金虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2846.4
- 红花: 11
- 帖子: 957
- 在线: 68.9小时
- 虫号: 2349854
- 注册: 2013-03-15
- 专业: 理论和计算化学
2楼2013-10-06 22:01:58
lishijunzong
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 214 (大学生)
- 金币: 5034
- 红花: 10
- 帖子: 574
- 在线: 195.1小时
- 虫号: 1121020
- 注册: 2010-10-13
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2013-10-07 08:32:30
therotyonth
金虫 (正式写手)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 2846.4
- 红花: 11
- 帖子: 957
- 在线: 68.9小时
- 虫号: 2349854
- 注册: 2013-03-15
- 专业: 理论和计算化学
4楼2013-10-07 09:06:22
40