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therotyonth

金虫 (正式写手)

应助: 9 (幼儿园)
金币: 2820.4
红花: 11
帖子: 952
在线: 68.9小时
虫号: 2349854
注册: 2013-03-15
专业: 理论和计算化学

[求助] Gaussian 09 处理后的文件始终无法在AMBER中的antechamber命令中完成

输入文件flu.com

--Link1--
%chk=molecule
#HF/6-31G* SCF=tight Test Pop=MK iop(6/33=2) iop(6/42=6) opt iop(6/50=1)

remark line goes here

0 1
……………………

PBS文件
#!/bin/bash
#
#PBS -l nodes=1:ppn=12
#PBS -l walltime=1444:00:00
#PBS -V

cd $PBS_O_WORKDIR

export g09root=/share/apps/software
source $g09root/g09/bsd/g09.profile
export GAUSS_SCRDIR=/state/partition1
date
g09 /home/flu.com
date
处理后的文件flu.log用以下命令
antechamber -i flu.log -fi gout -o flu.prepi -fo prepi -c resp -s 2
提示：
Running: /usr/local/amber12/bin/bondtype -j full -i ANTECHAMBER_BOND_TYPE.AC0 -o ANTECHAMBER_BOND_TYPE.AC -f ac

Running: /usr/local/amber12/bin/atomtype -i ANTECHAMBER_AC.AC0 -o ANTECHAMBER_AC.AC -p gaff

Running: /usr/local/amber12/bin/espgen -o ANTECHAMBER.ESP -i flu.log

espgen cannot deal with Gaussian 09 log file, please generate Gaussian 09 ESP file using iop(6/50=1) and rerun espgen
Error: cannot run "/usr/local/amber12/bin/espgen -o ANTECHAMBER.ESP -i flu.log" in resp() of charge.c properly, exit

这个是怎么回事呀？
刚刚接触计算，望各位大侠能帮帮茫茫哈！

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1楼 2013-10-06 22:00:03

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

应助: 214 (大学生)
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在线: 195.1小时
虫号: 1121020
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性别: GG
专业: 理论和计算化学

【答案】应助回帖

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感谢参与，应助指数 +1
therotyonth: 金币+3, ★有帮助, 谢谢哈！ 2013-10-07 09:07:18
therotyonth: 金币+10, ★★★很有帮助 2013-10-11 17:51:40
therotyonth: 回帖置顶 2015-02-06 09:38:39

试试G03吧，09好像不行