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微生物代谢组在LC-MS上信号很少,不知道为什么。
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| 做微生物的代谢组学,采用甲醇:水(70:30)于负20度的条件下提取代谢组,并辅助以负80度30分钟,冰上4分钟,混匀,这样的三个循环促进细胞破裂。离心得到上清液后在真空浓缩里旋干,样品重构于水中,进样LC-MS,扫描范围50-1000,但没有什么信号,代谢组不是应该得到的谱图有很多峰的么?是不是旋干的过程这些小分子都挥发了呢,求解释啊。 |
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agilent
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【答案】应助回帖
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依儿咏迥: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-10-10 19:09:29
依儿咏迥: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-10-10 19:09:29
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我不做微生物的,随便聊聊,不一定准确: 1、看下你的流动相梯度,是不是初始流动相太强,导致峰全在死时间出来了; 2、细胞破碎和酶的去活当然是在低温下操作,但是代谢物提取是不是可以温度稍高一点(如0度),水相比例高一点? 3、甲醇:水(70:30)提取溶剂对强极性的代谢物溶解性应该不是很好 4、细胞个数太少,复溶体积太大,进样体积太小,这些因素可能都会导致你最终什么峰。建议微生物用量加大点先试试。 5、试试其他细胞破碎的代谢物提取方法:如研磨、超声破碎等。 |
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4楼2013-10-10 10:07:22
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fe123333
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依儿咏迥