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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP+PHON算声子谱
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人生果

新虫 (小有名气)

[求助] VASP+PHON算声子谱

VASP+PHON算声子谱，我的理解是：第一步便是用PHON构建超原胞。我在执行phon命令后产生了DISP和SPOSCAR。下一步要做的就是，将DISP对应的原子移动加到SPOSCAR里。移动一次，用vasp做一次自洽得出受力。然后将所有的受力提出来得出FORCES。处理后就可以得出声子谱。
       请教各位大神，我的理解对吗？这里应该需要写几个脚本来执行上述操作，但是自己不会写，有没有人写过这样的脚本，还请共享一下，谢谢！
       另外，看论坛上各位大神说建议用phonopy算，但是实验室的电脑联不了网，编译是个问题，弄了两天都没成功。求助各位！谢谢！
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1楼 2013-10-03 23:24:10
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刘仕晨

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
fzx2008: 金币+3, 谢谢指导 2013-10-04 09:28:14
phonopy不需要很大的资源，哪怕你自己在自己笔记本上装个虚拟机也可以，phon好像太老了，上次更新还是10年，建议phonopy，装个虚拟机，装个ubuntu，再装个phonopy，很快的。
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2楼2013-10-03 23:29:29
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liliangfang

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
人生果: 金币+9, ★★★很有帮助, 谢谢斑竹 2013-10-04 14:12:59
identation: 金币+2, 谢谢交流 2013-10-05 16:41:17
编译好phonopy
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4874998
计算就好了，有一些处理办法见附件
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3楼2013-10-04 09:54:15
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人生果

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 刘仕晨 at 2013-10-03 23:29:29
phonopy不需要很大的资源，哪怕你自己在自己笔记本上装个虚拟机也可以，phon好像太老了，上次更新还是10年，建议phonopy，装个虚拟机，装个ubuntu，再装个phonopy，很快的。

谢谢，就是不怎么方便，算个东西还得先在家里弄弄，然后再跑实验室去弄，实在不行就只能这样了，在此感谢！
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4楼2013-10-04 14:16:39
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人生果

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by liliangfang at 2013-10-04 09:54:15
编译好phonopy
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4874998
计算就好了，有一些处理办法见附件

谢谢斑竹，您的这个帖子我看过了，附件里面是编译phonopy所需要的，之前就是按照这个在redhat里编译的，但是总是会报错 You must install numpy 1.4 or later to build，可我已经编译好了numpy了，反复编译了好几遍还是会报这个错误！
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5楼2013-10-04 14:22:18
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刘仕晨

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 人生果 at 2013-10-04 14:16:39
谢谢，就是不怎么方便，算个东西还得先在家里弄弄，然后再跑实验室去弄，实在不行就只能这样了，在此感谢！...

好的吧，不过难道你实验室没有普通的台式机或者笔记本么
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人生果
6楼2013-10-04 14:40:18
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chuanghua304

禁虫 (职业作家)
★ ★ ★
identation: 金币+3, 谢谢指教 2013-10-05 16:42:17
本帖内容被屏蔽

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

人生果
7楼2013-10-04 18:47:44
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人生果

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by chuanghua304 at 2013-10-04 18:47:44
建议用ubuntu或者是centos系统，装phonopy很方便、简单。因为更新那些软件包比较方便。ubuntu 用sudo apt-get install +name centos 用yum install +name 很方便。不要用red hat enterpriser 因为没有授权不能更新软 ...

谢谢，杯具得的是电脑不能联网，
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8楼2013-10-05 13:31:56
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人生果

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 刘仕晨 at 2013-10-04 14:40:18
好的吧，不过难道你实验室没有普通的台式机或者笔记本么...

有呀，为了保守国家机密，不能联网！惨了我们
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9楼2013-10-05 13:33:40
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liliangfang

荣誉版主 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 人生果 at 2013-10-04 14:22:18
谢谢斑竹，您的这个帖子我看过了，附件里面是编译phonopy所需要的，之前就是按照这个在redhat里编译的，但是总是会报错 You must install numpy 1.4 or later to build，可我已经编译好了numpy了，反复编译了好几遍 ...

有些步骤多重复几次就可以了
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10楼2013-10-06 09:29:23
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