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yini4632

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[交流] 真菌菌核RNA提取过程中的问题，求高手帮助已有5人参与

菌核里有大量的黑色素，用的trizol法提取的，氯仿抽提后的上清不是无色透明的，是褐色的，最后提取的RNA中总有褐色不容物质，depc水溶解，而且260/230在0.7左右，是不是表明有有机杂质，色素类都是一些酚类物质，怀疑是这些色素无法去除，请教高手如何除去这些杂质。单纯提取菌丝的RNA就很好，菌核就不行了。

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1楼 2013-09-24 21:27:44

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Fleaves

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★
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有色素影响什么？260/230也不是表明有有机杂质

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2楼2013-09-25 18:17:07

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yini4632

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2楼: Originally posted by Fleaves at 2013-09-25 18:17:07
有色素影响什么？260/230也不是表明有有机杂质

有人说上清褐色是由于多酚氧化形成的，会严重影响RNA提取，而且总觉得最后的粗体RNA中有机杂质多了，影响DNA酶的活性，我同时提取的菌核和菌丝的RNA，总是菌核的DNA即使用DNA酶处理也除不掉，但是菌丝里的DNA就除的很干净，RNA电泳和后期通过设计的内含子两侧引物扩增cDNA都显示没有明显的DNA。用于转录组测序的，RNA质量要求比较严格

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3楼2013-09-26 15:05:38

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