| 查看: 6591 | 回复: 9 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
高斯拉格朗日金虫 (小有名气)
|
[求助]
大家知不知道Vesta能不能呢手动连接两个原子之间的键啊？
|
||
| 感觉Vesta改变键长画图可不听话了，稍微小一点键就没了，稍微大一点又连得都是键，我想自己手动连接键，行不行啊？ |
回复此楼» 猜你喜欢
上海工程技术大学【激光智能制造】课题组招收硕士
已经有6人回复
-
带资进组求博导收留
已经有11人回复
-
自荐读博
已经有5人回复
-
求个博导看看
已经有16人回复
-
上海工程技术大学张培磊教授团队招收博士生
已经有4人回复
-
求助院士们，这个如何合成呀
已经有4人回复
-
临港实验室与上科大联培博士招生1名
已经有9人回复
-
写了一篇“相变储能技术在冷库中应用”的论文，论文内容以实验为主，投什么期刊合适？
已经有6人回复
-
最近几年招的学生写论文不引自己组发的文章
已经有11人回复
-
中科院杭州医学所招收博士生一名（生物分析化学、药物递送）
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 用vesta算原子间距离准确吗？
已经有9人回复
|
可以.....可以的 只是有得必有失 vesta 非常?姶髜可支援許多不同格式的檔案 其中一個叫 pdb (Protein Data Bank) 如果你能處理你的檔案變成 .pdb format 那就可以達成你的願望 下面我列出一個非常簡單的隨意的 pdb example 內容 COMPND test COMPND 1Created by VESTA HETATM 1 N1 0.944 0.961 0.944 1.00 1.00 N HETATM 2 N2 0.944 -0.944 -0.961 1.00 1.00 N HETATM 3 N3 -0.961 -0.944 0.944 1.00 1.00 N HETATM 4 C1 -0.965 0.965 -0.965 1.00 1.00 C END 這樣的結構 "有可能" 會造成 3D visualization 軟體無法產生 "鍵" 此時只要小修改~ 如下 COMPND test COMPND 1Created by VESTA HETATM 1 N1 0.944 0.961 0.944 1.00 1.00 N HETATM 2 N2 0.944 -0.944 -0.961 1.00 1.00 N HETATM 3 N3 -0.961 -0.944 0.944 1.00 1.00 N HETATM 4 C1 -0.965 0.965 -0.965 1.00 1.00 C CONECT 1 2 CONECT 2 4 END 如此一?韣 1, 2 原子就會?娖扔墟I~ 2,4 原子?娖扔墟I ( CONECT .. 我沒有拼錯~ 它就是這樣叫...不要打成 CONNECT 喔) 但~如同我一開頭講的 有得必有失 .pdb 檔案主要是處理分子系統 所以它不會有"週期性" 也就是你的 unit cell 那個 box 就會消失掉 我相信一定還有其它變通方式......暫時想不到 |
8楼2014-01-07 16:48:26
3楼2013-09-22 18:36:49
armaity
银虫 (小有名气)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 164.2
- 散金: 94
- 帖子: 69
- 在线: 43.6小时
- 虫号: 1335094
- 注册: 2011-07-01
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
4楼2013-09-23 09:22:16
dxcharlary
专家顾问 (职业作家)
-
专家经验: +83 - 1ST强帖: 2
- 应助: 251 (大学生)
- 金币: 10399.6
- 散金: 155
- 红花: 65
- 帖子: 3137
- 在线: 757.1小时
- 虫号: 936718
- 注册: 2010-01-04
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 第一性原理
5楼2013-09-23 11:24:46